光輪的超魔神胡帕降臨到石英高原，手中圓環飛舞間，精靈世界沉睡的一隻只傳說存在被喚醒過來。
芳緣的兩隻超古代精靈，固拉多和蓋歐卡。
神奧的時空雙龍，帝牙盧卡和帕路奇亞。
合衆的真實與理想之龍，萊希拉姆和捷克羅姆。
六隻傳說精靈，從邪惡胡帕六隻手臂的六個金色圓環中被召喚而出，這些被突然召喚出來的傳說生物，此時都被一股邪念侵蝕了心智，超魔神胡帕的力量遠超過它們，如今它們只不過是胡帕的傀儡，沒有了自己的思想。
石英聯盟這些天王們，還是第一次見到超魔神的恐怖，六隻傳說生命……竟被如此玩弄。
“毀滅之戰……開始了……”恐怖光影下，阪木喃喃自語，被機甲超夢重重保護起來，下一刻，滅世般的威壓覆蓋了整片石英高原。
也就是這時。
芳緣出現了一個駕馭着固拉多的力量開始灼燒海洋，想要把大海近乎烘乾，讓這個世界的陸地面也積急速擴增的男人。
紅衣男子展現了毫不留情的冷酷一面，他沉着無比，帶領部下軍團與無數強大的訓練家、精靈進行着廝殺。
“沒有想到另外一個世界的水艦隊竟然打敗了熔岩隊，不可原諒，那麼在這個世界，我和固拉多會向世人證明，陸地纔是世界的歸宿。”
另外一邊，一個駕馭着蓋歐卡，充滿人情味的人物激昂的在海洋上對着部下演講，期間無數島嶼被海洋吞沒，傾盤大雨席捲芳緣，作爲所有生命來源的海洋麪積得到了無與倫比的擴增。
“小的們，赤焰鬆那個傢伙就在另外一邊等着我們！！接下來，不用我說該怎麼做吧！！”
赤焰鬆和水梧桐原本就是死對頭，兩人都來自已經完成了各自理想的世界，水梧桐來自一個“成功以蓋歐卡將世界都變成海洋的時空”，而赤焰鬆則是從一個“成功以固拉多將世界都變成陸地的時空”中而來，兩人被阪木邀請加入彩虹火箭隊後，自然誰也不服誰，正打算以這個新時空作爲新戰場，進行一次巔峰對決來證明對方的觀點是錯誤的。
這個時空的固拉多和蓋歐卡已經被超魔神胡帕控制，這也是阪木的信號，這個世界本土的傳說精靈將不會影響到他們的腳步，兩人都在各自時空成功以對應寶珠融合自身，控制了固拉多和蓋歐卡，所以如今的芳緣，他們便代表着大自然。
熔岩隊與水艦隊的露面，讓各地的道館訓練家紛紛出動，前任冠軍大吾和現任冠軍米可利，也兵分兩路，開始前往兩大組織所在。
神奧地區。
時空雙龍被召喚走後，身邊站立着來自另外一個時空的帝牙盧卡和帕路奇亞的赤日平靜無比。
他來自一個“成功以帝牙盧卡和帕路奇亞創造出了一個沒有心存在的完美世界的時空”，原本赤日覺得自己已經完成了理想，可是他卻沒有想到，世間上還有無數個平行時空，彩虹火箭隊的到訪，讓赤日明白了自己不能停下腳步，不然他創造的美好世界，遲早會被那一個個野心家毀滅。
“希望不會有人來阻止我吧，”赤日遙望天空。
彩虹火箭隊幾人，都有着自己的理想，這些野心家的理想大多對立，各自自然不可能和平共同，加入彩虹火箭隊，也只是不願意落後對手，每個人都覬覦着彩虹火箭隊的技術，阪木的地位，正如阪木所說，他無法壓制每個人，彩虹火箭隊的形成，代表着一場更殘酷的博弈。
合衆地區的魁奇思更是如此，他在原本的世界收服了捷克羅姆和萊希拉姆，實力極速膨脹，加入彩虹火箭隊的最大野心，就是想要操控阪木代替Ｎ作爲自己的傀儡。
對於這片新的合衆，魁奇思很滿意，這裡會是等離子隊一步步吞併彩虹火箭隊的起點，不過在那之前，需要清理一些礙事的人，這樣才能把這個合衆佔領，讓其成爲等離子隊的新領地，也只有如此……
他纔有資格去與另外五個人博弈。
阪木、赤焰鬆、水梧桐、赤日、魁奇思、弗拉達利，六個人各自代表了一方勢力，代表了不同的理念。
他們之間不可能互相認可，互相信服，所以這個世界會成爲他們博弈的戰場。
而這個世界的精靈聯盟，這個世界的訓練家，顯然沒有被後五人看在眼裡，或許是他們那個時空的聯盟過於無能，或許是因爲他們如今的力量過於龐大……又或許是之前的經歷，給了他們足夠的信心。
但是面對這些窮兇惡極的野心家，精靈聯盟卻不能坐以待斃，道館訓練家也好，四天王也好，冠軍也好，全部出動，甚至一些民間的訓練家，也都紛紛站了出來，加入到了抵抗的大軍中。