原來奈特已經找到了他的孩子，現在擔任學院領導人的聖父。但和遊戲中不一樣的是，當他把諾拉一起叫到學院裡的時候，他們的孩子尚恩因爲絕症已經奄奄一息，最後死在了他們的懷裡。但這比遊戲裡面已經幸運得多了，至少在時隔60年後，他們一家又重新團聚了。
不過臨死前聖父尚恩把自己的位置交給了奈特，奈特通過一系列談判與戰鬥鎮壓了學院裡的反對者後。以承諾停止對地面的所有敵對行爲。不再使用合成人替換廢土居民，釋放所有願意自由的合成人以及暫停有自我意識的和成人制造爲代價取得了鐵路的和解。
當然鐵路方面也承認，之前洗掉合成人的記憶並注入他們編織好的記憶以及對合成人整容之類的事情，只是在那種困難的環境下的某種應急措施。以後他們只會重新編織自願改變記憶的合成人的記憶。
現在奈特希望作爲民兵將軍的萊恩和他合作，集中鐵路，學院與民兵的力量重建這片土地上的秩序。
“那鋼鐵兄弟會呢？”萊恩問道。
“我現在就希望能集合我們的力量讓兄弟會坐到談判桌前來，畢竟這片土地上已經流了太多的鮮血了。”
“好吧，談判那天叫上我，我和你們一起去。”萊恩答應了奈特的請求。
最後萊恩問了奈特了一個上輩子玩遊戲就沒搞明白的問題：“爲什麼學院要製作第三代合成人？明明第一代合成人就能完成的工作，學院爲什麼非要製作出有自我意識的合成人給自己添堵？”
“我想這是學院裡人長時間自我封閉後，看見地面上的落後與愚昧後把自己當成了神靈的原因吧。”奈特用有些無奈的語氣說道。
“所以他們妄圖製造一種新的生命取代現有的人類，然後他們作爲高高在上神靈統治一切。”
“果然如同偉人說的那樣，路線錯了，知識越多越反動。”萊恩感慨道。“如果學院技術不用在這種歪門邪道上，而是用來改變聯邦廢土的話。很可能聯邦現在已經變成了適合人類生存的好地方了。”
“沒錯，這就是我爲什麼選擇接受學院領導權的原因了。雖然我依然恨他們奪走了我的孩子，也厭惡他們之前的所作所爲。但我知道它裡面的技術說不定能改變整個世界，所以，我希望我可以改變學院讓學院真正回到正軌上來，爲他們之前的所作所爲贖罪。我覺得這樣子對整個聯邦甚至整個世界來說，遠比爲了一時痛快徹底摧毀它更好。”奈特有些痛苦，但依然堅定的說。
“你說得對。”萊恩踮起腳拍了拍奈特肩膀。“我希望未來無論如何都能讓這片廢土上的生靈團結起來，動員一切力量改變這個世界。雖然我對於這個世界來說只是一個路過這裡的旅行者，但我依然希望這個世界會有未來。畢竟你知道我是一個位面商人，只有每一個世界都變得繁榮起來，我才能賺到更多的好處。”
奈特這時候也從痛苦中恢復過來，“無論如何都要謝謝你，萊恩。至少在你幫助下，各個據點與農場都是煥發出了新的生機。反正我一路過來的時候遭到襲擊的次數要比我離開的時候要少得多了。”
當天，奈特就在庇護山莊住下。現在民兵的司令部被安置在庇護山莊了，因爲這裡有更大的發展空間。而原來的城堡則作爲民兵的一個重要要塞與東部沿海新兵訓練中心。
庇護山莊之前也做了不少的建設，民兵們動用了大量的人力和機器人圍着111號避難所的小山上修建了一座新的要塞羣，並在裡面設置了醫院，倉庫和學校。而把庇護山莊作爲要塞附屬的城市供大家居住和種植。
由於庇護山莊這裡的土壤已經被徹底的淨化了，所以建設起了大量的大棚，並利用修好的電腦與機器人把大棚變成了智能自動化農場。
正因爲有了大棚的存在，植物們才能避開輻射風暴與輻射雨健康成長。現在，這些基本消除了輻射與病毒污染的庇護山莊的農產品成爲了這片廢土上居民的新寵，而民兵發行的食品券則有成爲廢土的新硬通貨的趨勢。
兩天後，鋼鐵兄弟會派信使帶來了同意談判的回信。約好第二天中午大家一起到鑽石城談判，每一方只允許有一個領袖，一個副手以及十名護衛。萊恩覺得兄弟會和遊戲裡區別太大，有點太好說話了。於是做了一些準備，畢竟防人之心不可無。
第二天一早，萊恩穿上新做的將軍制服（舊的太大穿不了）和普雷斯頓以及十名機動民兵每個人乘坐着一臺機器人往鑽石城趕去。
機動民兵是萊恩剛組建不到一週的隊伍，鑑於有些敵人不是半職業民兵可以對付的，所以萊恩組織了一些有豐富戰鬥經驗的民兵作爲機動部隊來作爲本部直屬的精銳力量。
他們每個人都穿着防彈布與防彈甲結合起來的制服，並攜帶帶着足夠的武器彈藥和符文石。最重要的是每個人都有一臺武裝過的機器人作爲他們的載具和戰鬥夥伴。而這次談判是經過短暫的培訓後他們的第一次亮相。
到達鑽石城門口後，萊恩發現鐵路的人已經在那裡等他們。領頭的是一頭金髮的中年婦女，這應該就是鐵路領袖戴瑟蒙娜了。
看見萊恩他們後，戴瑟蒙娜先是驚訝了一下民兵將軍萊恩的年齡，然後上來握了握手說到：“非常感謝你對我們正義行爲的支持，也非常感謝你們能對合成人一視同仁。”
“我們民兵致力於在這片廢土上重塑秩序，剷除廢土上的邪惡，所以我們肯定會對所有認同我們理念的生物一視同仁。無論他們是合成人，有智慧的屍鬼甚至是願意與大家和平相處的變種人。”
說到這裡萊恩頓了一下，然後擡頭看着戴瑟蒙娜認真的說：“但是我還是希望你們不要再把那些合成人秘密投放到各個據點了，那些莫名其妙冒出來的合成人實在讓我們緊張。”
“抱歉，以後不會了。學院現在願意改變對待和成人的態度，我們也沒必要讓那些合成人隱姓埋名的滲透進各個據點。說真的，如果學院願意真的改變他們的做法，那麼我想鐵路會在某一天真正的消失，不過我們全體成員對這種未來感到非常開心。”戴瑟蒙娜用輕鬆的語氣說道。
正當萊恩和戴瑟蒙娜說到學院的時候，一陣藍光閃過。奈特帶着維吉爾以及追獵者們來到了鑽石城門口。
雖然鐵路方面的成員們依然臉色不好的看着學院一方，但是雙方領袖還是握了握手錶示和解。
在大家站着等了一會兒後，天邊傳來了發動機的聲音，看來會談最後一方鋼鐵兄弟會終於到了。