經過一場大戰後，雨忍幾乎敗局已定，半藏也再沒有負隅頑抗的能力，只好立即帶領雨忍撤回了雨忍村，而雨忍村四周環水，易守難攻，木葉一時也難以攻進，於是戰況就此陷入了僵局。
木葉軍隊試着進攻了雨忍村幾次，但都是以失敗收場，無奈之下，木葉只好派出使者，勸半藏主動投降，簽訂投降協議。
然而半藏卻毫不客氣的趕走了木葉的使者，寧死都不投降。
半藏不投降，雨忍村木葉的軍隊又攻不進去，而在這麼幹耗着，對木葉的補給又消耗太大，無奈之下，浮瑩只好暫時選擇了退兵，然後佔領了幾個雨之國的村莊，就地獲取補給。
戰爭就這麼僵持了幾個月的時間後，木葉終於還是撤走了大部隊，只留下一些小部隊繼續與雨之國僵持，而魂葉也被浮瑩強行帶回了木葉。
本來三忍也要跟隨大部隊一起撤離，但就在他們撤退的路上，他們卻遇到了在戰爭中流離失所的三個孤兒，自來也因爲不忍見他們孤苦無依，所以就決定留下來，照顧他們三人一段時間。
而這三個孩子正是彌彥，小南和長門。
自來也本來只是想將這幾個孩子培養成人，讓他們能夠在這亂世中存活下去，但哪料到在機緣巧合之下，長門竟然意外暴露了他輪迴眼的能力。
而見識到長門的輪迴眼後，自來也立馬想起了大蛤蟆仙人的預言，心中不禁猜想長門也許就是他要尋找的命運之子。
於是自來也才正式收他們三人爲徒，在傳授他們本領的同時，還教導他們追求和平的思想。
另一邊，大部隊在回到木葉後，所有人就立刻恢復了平靜的生活，而魂葉此時卻閒不下來，因爲在回到木葉後，她立馬看到了一個特殊的人物。
原來在那天回到木葉的時候，不少村民都跑來迎接各自的家人榮譽歸來，而魂葉的家人凌子卻沒有出現，而她的族長浮瑩卻立馬跑去火影大樓做彙報，所以魂葉只能無聊的打量四周，觀察周圍的其他人。
魂葉先是看到了悄無聲息消失在人羣中的大蛇丸，然後又看到人羣中一個少年突然衝着綱手跑去，而綱手看到那個少年後，竟然破天荒的露出了溫暖的笑容。
那個少年約麼十一二歲，看起來十分陽光可愛，髮色與綱手有一些類似，是棕黃色，而這個少年正是綱手的親弟弟繩樹。
“繩樹已經這麼大了，看來距離他遇難的事件應該不遠了。”魂葉盯着一臉陽光的繩樹，心情沉重的想道。
既然知道了繩樹日後肯定會遇險，而且綱手還會因此遭受重大打擊，而大蛇丸也會因此而黑化，開始追尋靈魂不滅的手段，魂葉便下定決心，一定要想方設法阻止此事的放生。
想到此處，魂葉便打算走上前與綱手和繩樹打個招呼，趁機與繩樹認識一下。
然而她纔剛邁出一步，就突然臉色一凝，因爲她撇到人羣后方的一顆大樹上，一個頭戴面具的暗部忍者正盯着她。
那個暗部忍者見到魂葉後，立馬向她做了一個特殊的手勢，然後就一閃而逝，魂葉只好暫時放棄與她們二人打招呼的打算，立刻穿過人羣，然後悄無聲息的消失在街道上。
魂葉再次出現時已經來到了半藏的秘密地下室，原來剛剛的那個暗部忍者正是經常負責替半藏聯繫魂葉的忍者。
“不知半藏大人找我有何事？”魂葉此時雖然實力已經強過半藏，但卻依舊在半藏的面前表現的恭恭敬敬，因爲第二次忍界大戰後，半藏馬上就會活躍起來，所以她此時還不想與半藏撕破臉皮，而是依舊留在他的揮下，好趁機獲得一些隱秘的情報。
“你這次私自與半藏交手鬧出如此大的動靜，你就沒有什麼好說的嗎？”半藏的臉隱藏在黑暗之下，看不清他到底是什麼表情，聲音陰沉的問道。
“我只是想替鏡老師報仇，倒是沒有想道會引起這麼多的事端。”由於搞不懂半藏到底是對此事持什麼態度，魂葉只能老老實實將她想法說了出來。
“但是你在行動之前爲什麼不跟我打個招呼？”半藏繼續問道，魂葉能夠聽出，半藏的聲音中帶有一絲怒氣。
“屬下被仇恨矇蔽雙眼，衝動的失去了理智，還望半藏大人恕罪。”魂葉沒有過多的解釋，而是連忙認錯道。
聽到魂葉的認錯，半藏沒有立即說話，而是雙眼緊緊的盯着魂葉那滿是愧疚的臉龐，似乎想要從中看出什麼，然而他看了許久，卻依舊沒有發現魂葉有什麼不對的神態。
片刻之後，半藏終於收回了目光，然後也沒有責罰魂葉，而是苦口婆心的跟她說了一堆說教，想要從精神上徹底征服魂葉，而魂葉聽完半藏的講話後，立馬配合着露出感激涕零的表情，半藏這才滿意的點了點頭。
“好了，接下來你給我講講你也半藏戰鬥的詳細經過吧，我也想了解一下半藏的實力到底如何。”
講完此事後，半藏卻沒有立馬放魂葉走，而是突然問起了魂葉與半藏的交手經過。
關於她們那一戰的情報，魂葉相信半藏手中早已有了詳細的資料，但他如今卻讓魂葉來講解，顯然並不是簡單的抱着瞭解半藏實力的目的，但魂葉也摸不清他到底是爲了瞭解她的實力，還是試探魂葉是否會隱藏什麼信息。
魂葉腦筋快速轉動，一瞬間就想了許多，然後還是決定將整個戰鬥過程如實的講給了半藏，只不過時間畢竟過去了一段時日，她也記得沒有那麼清楚了，所以講的並沒有那麼詳細而已。
半藏聽完魂葉的講解後，只是點了點頭，然後也沒有說什麼，就這麼任由魂葉離去。
但就在魂葉走出密室後，他原本面無表情的臉上，卻突然出現了忌憚之意。
“輪迴魂葉，想不到她竟然成長如此之快，輪迴一族還真是有着讓人羨慕的血繼限界能力啊。”半藏一臉忌憚的喃喃道。
但是提到血繼限界能力後，他的眼中卻突然出現了渴望的神色，那種眼神就彷彿在沙漠中飢渴了許久的人，突然見到水後，就算不折手段也要得到水的瘋狂眼神。