解決完這裡的事情後，劉偉峰就被老人送到了凱那市。凱那市因爲靠海，所以幾乎所有的訓練家都有水系的寶可夢。這對煤炭龜來說是個災難，但是對於蘑蘑菇來說就不是了。
在這裡，劉偉峰再次遭遇了水艦隊的行動。不過只幹掉了兩個小嘍囉就結束了。然後就是前往下一個道館的所在地，紫堇市。
沒錯，凱那市並沒有道館，只有紫堇市有，這個道館是電系道館。打敗對方以後，劉偉峰就去拿了自行車，通了隧道。然後因爲沙暴進不了沙漠，纜車又被堵上，只能繞遠路前往秋葉鎮。
秋葉鎮是一個被火山灰佈滿的城市，遊戲裡還可以通過收集火山灰來製造一些道具。不過劉偉峰這裡沒興趣了。
通過秋葉鎮以後是流星瀑布，一個很美的地方。在這裡，遇到了水艦隊和火巖隊這兩個反派的對抗。當然，這跟劉偉峰沒什麼太大的關係。
然後就追着他們一直到一座山上，打敗了火巖隊的首領後，就可以繼續前往下一個地方了。
下一個道館是在釜炎鎮，一個靠着火山溫泉起步的小鎮。而這裡的道館當然也是跟着火山有關，都是火系的寶可夢。實力還可以，道館訓練家最後壓箱底的是一隻煤炭龜。
只不過面對劉偉峰現在這隻快一米五高的煤炭龜，對面的就像是個弟弟。
拿到第四枚徽章後，就有人過來送了一個防風眼罩。有了這個眼罩以後，劉偉峰就可以進入沙漠了。
當然，現在的沙漠裡面並沒有什麼好東西，除了一些在沙漠裡面的寶可夢和一些訓練家。
接下來，就是回到一開始的地方，去打第五個道館。第五個道館雖然是一般系的，但是實力也是很強。
在打完這個道館以後，就能學會衝浪了。有了衝浪，再抓一隻能夠帶的動自己的寶可夢以後，劉偉峰就可以自己出海了。
至於劉偉峰抓的寶可夢，是一隻吼吼鯨，並且進化到了吼鯨王。吼鯨王一般不參與戰鬥，因爲它的體型實在是太大了，十五米高，相當於一隻真正的鯨魚。但是因爲在後面很有用，所以劉偉峰特地抓了一隻。
第六個道館是飛行系道館，劉偉峰還順便學會了飛天。有了這個能力以後，他就可以飛到去過的城市那裡了。而不用自己在靠雙腳跑過去。
這個道館有個麻煩的地方是路口被東西擋住了，必須找大吾先生拿到一個探測鏡以後，才能發現堵路的是一隻寶可夢，變色龍。
拿到第六個徽章後，繼續前進。又是水艦隊的麻煩，劉偉峰不得不繼續更上去，在送神火山，也就是寶可夢墓地的頂上，打敗了水艦隊，但是也發現有了兩顆寶石不見了。
這兩個寶石的作用是控制這裡的兩大神獸，固拉多和蓋歐卡的。這兩隻還有裂空座其實都是劉偉峰的目標之一。
然後，劉偉峰按照劇情找到了火巖隊的基地，發現了正在召喚固拉多的火巖隊首領。戰鬥結束後，固拉多也跑了。
接下來，回到凱那市，在那裡找到水艦隊的基地，打完基地以後，劉偉峰才發現水艦隊的老大也不在。所以劉偉峰只能繼續追上去。
一隻追到了海上的一座小島，綠嶺市。這裡也是第七個道館的所在地。所以拯救世界的事情我們先放一放，先把道館徽章給打了。第七個道館是雙胞胎，超能系不說，還是二對二。
所以就變成了劉偉峰和黛西，打對方兩個。最後還是被劉偉峰他們拿到了第七個徽章。
打完以後，又發現了火巖隊的身影，只能繼續追過去。跟大吾一起打敗了火巖隊的首領，並讓他們放棄了自己的計劃。
之後，大吾給了劉偉峰潛水，讓他可以直接進入水下戰鬥。只不過水下的話，就只能使用水系寶可夢了，比如吼鯨王。
在海底找了好一會兒以後，劉偉峰抓到了一隻古空棘魚。一種據說一隻都沒有變化過的化石寶可夢。這個也是有着巨大的作用的。不然劉偉峰也不會先抓它。
抓到古空棘魚以後，劉偉峰纔去找水艦隊。在海底的一個洞窟裡面找到了水艦隊老大和另一隻神獸蓋歐卡。
這兩個神獸的力量可是很強的，光是自身的存在就能夠改變天氣。固拉多是大晴天，而蓋歐卡則是暴雨。兩隻神獸一起出現以後，豐緣地區的天氣就變得很詭異了。
在大吾的提示下，劉偉峰前往了琉璃市，還見到了兩隻神獸大戰的畫面。而要他們平息的方法只有一個，那就是找到裂空座。
在天空之柱找到裂空座以後，兩大神獸的戰鬥很快就平息了下來。
而劉偉峰也去挑戰了最後一個道館，拿到了最後一個徽章。
八大徽章集齊，那就是這個遊戲的最後一關，四大天王和冠軍，分別是惡系，幽靈系，冰系，龍系和水系。只要用等級和對應的剋制屬性招式碾壓過去就行了。這個不是什麼太難的東西。
通關這個以後，就算是一週目結束了。但是主線任務還差一個，那就是擊敗三大神獸。正常情況下，普通的寶可夢是打不過神獸的，但是劉偉峰的寶可夢都都是開了念，甚至還有很多獨特的能力，所以劉偉峰一個個找上門去。
首先是固拉多，在丟了數百隻最好的精靈球以後，終於抓住了，然後直接被黛西封印在了自己體內，並且掌握了固拉多的特殊能力，日照。這個效果會觸發大晴天，火系招式威力增加50%，而水系招式威力減少50%。
但是第二隻蓋歐卡和裂空座就沒那麼好弄了。因爲一個被劉偉峰打敗後躲進了不知道那裡的海溝裡，沒找到。一個直接飛在空中，不下來了。
沒辦法，劉偉峰只能去抓另外三隻神獸，三神柱。這三個據說是有拖動大陸的神獸雷吉奇卡斯創造的，分別是冰神柱，鋼神柱和巖神柱。
而這三神柱的獲得方式也很隱蔽，需要在海上找到一個洞，潛水進去找到一串代碼後，用挖洞，把古空棘魚放在最前面，吼鯨王放在最後面。然後就能找到豐緣地區有三個被六個岩石包裹的大岩石。
這個時候，洞已經有了。劉偉峰需要到這三個地方，找到特點的地點，分別用怪力，飛天和靜止不動兩分鐘，就能遇到巖神柱，鋼神柱和冰神柱。然後就可以抓了。
找到這三神柱後，黛西也封印了鋼神柱毒素免疫，防禦增強。而且封印了兩隻神獸的緣故，黛西也擁有了對應的屬性，地面系和鋼系，並且可以學習寶可夢的各種技能。
想了想這裡定點的神獸就這麼幾隻以後，劉偉峰和黛西就退出了當前世界。