又半個月後，經過精心的安排，火箭隊首次公開進攻各大城鎮。由此，神奇寶貝世界歷史上最黑暗動亂的時代拉開了帷幕。
以胡飛掌控火箭隊爲原點，時間向後推移計算。
1個月後，火箭隊四幹部之一，忍者阿桔帶領百餘火箭隊精英，悍然突襲尼比市。不僅踏平尼比市的道館，而且劫掠了著名的尼比博物館。
尼比博物館是尼比市最主要的建築之一，兒童票要50元。在一樓有化石翼龍和鐮刀盔的化石，進行的神奇寶貝化石展覽。二樓有一塊空地放着巨大的哥倫比亞航天飛機的模型。平常遊客還可以見到來自於月亮的月之石的傳聞。
這些最珍貴的化石被阿桔奪走。胡飛將其全部調撥給新建立的火箭隊0號科研所。說科研所其實名不副實，因爲全科研所的科學家只有超夢一員。
胡飛將得自正輝的神奇寶貝心情資料、夏伯的化石還原技術統統交給超夢。超夢原本的智力便和人類相當，又因爲是超能系神奇寶貝，腦域發達，善於計算推導。
這些化石都經過超夢的還原，化成活生生的古代神奇寶貝：化石翼龍、菊石獸、化石盔。
憤怒之湖的變異神奇寶貝計劃，也因爲正輝的資料，順利完成。第一個改造變異成功的案例，便是胡飛手中的那隻暴鯉龍。由於多次戰鬥敗北，自尊心受到刺激，主動溝通胡飛要求自我變異。變異成功之後，獲得新生的暴鯉龍，全身通紅亮麗如火，身形暴漲一倍，屬性亦多有拔升。
1個半月後，火箭隊四大幹部之一的電系達人馬志士，隨後出動。攻佔彩虹市，將關東地區最大的神奇寶貝用品市場——彩虹百貨大樓劫掠一空。大量的精靈球、消耗型進化石、神奇寶貝道具、各類秘籍學習機充實到火箭隊軍備庫中。
同時，在紫苑鎮，著名的神奇寶貝墓地陵園——神奇寶貝塔，被娜姿帶領數十名火箭隊精英戰鬥人員順利清理。不僅將這裡的幽靈系神奇寶貝一網打盡，更暗中將此塔改造成了電臺。從此火箭隊的通訊完全覆蓋整個關東、成都地區，無有漏網之遺。
三個月後，一直將全部資金調配給超夢使用，進行的複製神奇寶貝計劃也獲得了成果。
複製的主要小精靈有：電系頑皮彈，毒系雙彈瓦斯，超能系椰樹蛋，冰系鐵甲貝。這項複製實驗的成功，讓胡飛埋藏在心底的神奇寶貝訓練師軍團規模化的想法，得以成功實現。
爲什麼在神奇寶貝世界中，長久以來都是訓練師之間的單打獨鬥，即使是多人戰鬥，也不過是雙人戰？這是因爲神奇寶貝的培養、配招，訓練師的想法，都有着很大的差異，具有特別各異性。
一個訓練家的培養，是從10歲開始，進行個人修行旅程。這種過程，無形中養成了訓練家單打獨鬥的習慣。同時寵物小精靈之間的個體差異，導致配招不一，戰鬥的習慣也不一樣。
但是這些問題，在複製神奇寶貝身上，全然沒有。一個個的複製體，屬性一致，絕招一致，甚至戰鬥習慣都完全相同。
胡飛利用這些小精靈，各組合成了500人的軍團，分別由四大幹部率領。火箭隊的整體軍事實力，由此暴增爲世界第一。
4月底，來自精靈聯盟的反撲到來了。不僅是關東聯盟、橘子聯盟，甚至就連豐緣聯盟、神奧聯盟都派遣最優秀的訓練家，一齊來扼殺火箭隊這個和平世界的毒瘤。
然而。
哪怕再優秀的訓練家，培育再棒的神奇寶貝，又能撐得住幾次攻擊呢？50次？100次？
胡飛給軍團精靈統一配招，多爲遠程絕招。頑皮彈的電擊、雙彈瓦斯的毒氣，椰樹蛋的葉葉風暴，鐵甲貝的加農炮。更陰險的是，頑皮彈、雙彈瓦斯、椰樹蛋都是可以自爆的單位，鐵甲貝的變態防禦更令敵人噁心不已。
想象一下，500單位的電流衝擊，在天空中交織成電網。或者2500枚的尖刺加農炮同時飛在空中的壯闊場景吧。
最關鍵的是，這還僅僅只是整個軍團一輪攻擊的輸出效果而已。
一個螞蟻的力量微乎其微，但是一個蟻羣的力量卻能令大型昆蟲心驚膽寒。火箭隊軍團中除了統領之外，隨意拉出一個人也許都不夠這些精靈聯盟訓練家塞牙縫的。但是一旦攻擊規模化之後，量變引發質變，胡飛統領下的火箭隊便以橫霸天下的絕對氣勢，掃蕩所有的障礙。各大精靈聯盟聯合的絞殺，完全成了一個笑話。
就在火箭隊淫威赫赫，令天下都陷入絕望和黑暗之中的時候，一個人毅然決然地站出來，並以英雄的姿態，拯救世人於水深火熱之中。
小智？
當然不是。他還沒有成長到那種高度呢。
卻是胡飛以閃耀之星公司總裁，擁有8枚徽章的優秀訓練師，年輕俊傑的身份，出現在人民大衆的視野中。
他英俊瀟灑，優雅從容，一笑起來彷彿世上再沒有什麼難事。
他聲望頗高，先後戰勝小剛、小霞、艾莉佳、板木等等道館館主。
最重要的是，他擁有可以匹敵火箭隊的力量！“萬人無敵，天空中最閃耀的新星”是世人送給他的讚譽。
！