在陸中天和昆金的努力之下，新生的防衛軍正在重建之中；同時，茉莉她們一直在努力尋找散落在各地的防衛軍成員們，一同對抗百特星人！！
這天深夜，在小光的夢境中，正發生着她最不想看見的事情：這是三個巨人之間的戰鬥！一方是百特星人，另一方則是她的父親————風狄奧特曼，以及母親————風娜！就在一瞬間，風狄與風娜使用了生命爆炸，與百特星人同歸於盡了………… 就在這時，小光被驚醒了，猛地坐了起來大叫：“父親！？”
隨着小光的驚醒，其他人趕緊趕了過來；小利問道：“夢見父親了？”見小光點點頭後，昆金嘆了口氣，說道：“小光，不僅僅只有你想着你父親，我們每個人都很希望你父母能夠回來。不過現在着急也不是辦法，只能靜靜地等待才行啊！或許，防衛軍重建之後就會回來也不一定哦。”
小光看了看昆金後，吁了口氣後笑了笑：“知道了，叔叔。”想了一下後說道：“最近比較心煩，老哥，陪我出去走走，行嗎？”小利笑了：“方正最近學校放假，我沒意見啊！只不過，我覺得有一個人若知道了，鐵定會跟你去的。”
小光一愣之後，笑了一下：“那就去蒙古的戈壁灘，借用死亡之蟲的傳說嚇死他。怎麼樣？”
茉莉聽後樂了：“的確。這種蟲子是可以嚇到陸毅的。據說是出生在茫茫的戈壁沙丘中，擁有着巨大的血紅色身體的蟲子，它們形狀十分怪異，會噴射出強腐蝕性的劇毒液體。此外，這些巨大的蟲子還可從眼睛中放射出一股強電流，讓數米之外的人或動物頃刻斃命，然後，將獵物慢慢地吞噬……因此，大家把它稱爲‘死亡之蟲’。這種蟲大多有1.5米多長，長得如牛腸一般。它通常是紅色，身體兩端有時會探出犄角。這種蠕蟲極爲危險，它噴射的致命毒液和釋放的電流能擊中數英尺外的目標。
“據說，曾經捷克共和國研究小組的負責人伊凡.邁克勒，他曾三次搜尋這種蠕蟲。邁克勒在第二次探險中試圖用高能炸藥引誘蠕蟲露出沙漠，但未能成功。2004年，他重返戈壁灘，這次他採用低飛技術來拍攝廣袤的沙漠。但在這次探險中，他未能用相機捕獲到蠕蟲的任何蹤影。據說，此蠕蟲要用散彈槍才能將其擊斃，這也是恐怖之處。因此要去的話，要小心爲妙。”
小光笑了：“阿勝哥哥陪我去就行了嘛。”於是，大家回各自的房間繼續睡覺了。
第二日，小利，小光和阿勝啓程前往蒙古的戈壁灘了，進行爲期十日的旅程；這次的蒙古之行，對小利、小光以及阿勝來說，是命中註定的行程，對各自的人生有着很大的影響意義！
另一方面，陸毅聽說小利、小光要去蒙古的戈壁灘，而且是下午的飛機，瞬間就坐不住了，衝到陸中天的書房裡對陸中天說：“老爸，趕緊的，幫我訂一張下午三點的飛機去蒙古！”
陸中天微微一愣後說着：“就知道你肯定會去，而且非常急，小利昨晚就跟我說了一聲後，讓我叫你只要去飛機場用身份證去，就能領到和他們同一架飛機的飛機票了。”
陸毅一聽樂了，抱着老爸狂親了一口，邊往外面跑邊說：“老爸！多謝了！”見陸毅幾秒鐘就消失在了房門口，陸中天無奈得笑了笑：“唉…………這孩子真是的。很擔心以後會怎麼樣。”
這時候，從一邊的房間中走出了一個少女，與陸毅、小利、小光一般年紀；這個少女發出了銀鈴一般的笑容說着：“真不知道小利、阿勝哥哥和小光姐姐會怎麼想呢？！我也去看看。”陸中天見這個少女出來，立刻迎了上去：“這樣做，真的好嗎？琪琪，你父親爲什麼會這麼安排呢？”
這個少女，正是由大艾製造而出的生化少女——琪琪。
琪琪說：“他並沒有因爲我是機器人而對我冷漠過，反而還是想對待小利哥哥和小光姐姐一樣的，對我照顧的無微不至，使我幾乎都要忘卻自己只是一個生化人類。如若當初沒有將我從殘次品裡面弄出來，我也沒有今天。陸大叔，我們不都是一樣的嗎？”
陸中天笑了笑：“沒錯啊！琪琪，準備什麼時候動身？”琪琪想了想後說：“和陸毅他們一架飛機吧。之後，這邊就拜託您咯！”陸中天點了點頭。
第二天，小利、小光、阿勝、陸毅、琪琪先後登上了前往蒙古的飛機了。不過，琪琪坐在了豪華單人間中，暫時不與小利等人見面；不過，小利他們卻和陸毅見到了，問明原由之後，調整了位置後，他們幾個坐到了同一包間之內了。
小利開玩笑的說：“沒行到陸大少爺也會有勇氣去蒙古哦。長大了哦！”陸毅自信的點了點頭，瞬間堅決不對：“不對啊，小利。你又不是我爸，爲什麼說我長大了？瞧不起我啊。”隨後的旅程上，他們幾個有說有笑的。
另一邊，琪琪打開隨身電腦看着屏幕上的一切，默默地說着：“拉斐爾，還沒好嗎？”
拉斐爾到底是什麼呢？究竟對琪琪來說，這意味着什麼呢？在基督教、猶太教及伊斯蘭教的信仰裡面，這是一位天使長的名字。據傳他行使一切治癒的神蹟。由於拉斐爾是操治癒術的天使，和蛇的形象便有了牽連。拉斐爾爲第二天的支配天使、力天使的君主、伊甸園生命之樹的守護者、經常站之在神的御座前的七名天使之一。拉斐爾的傳說極其紛亂，他既是大天使，又是力天使，卻有熾天使的六翼，又同時屬於智天使、主天使、能天使三位階。拉斐爾的形象一直都是愉快的，除了治癒人的疾苦，還傳授諾亞建造方舟的知識與技巧。舊約記載與雅各摔角、解除亞伯拉罕老年行割禮的痛苦的天使亦相傳是拉斐爾。他治療的不僅是人的身體，還包括人的信仰。 在諾亞奧特曼被封印大部分力量之時，所治癒第三位適能者之缺陷的，也是拉斐爾的藥物。
琪琪和拉斐爾，究竟是什麼關係呢？莫非，琪琪也能夠成爲真正的人類嗎？還是，拉斐爾是能夠讓所有勇士回來的關鍵所在嗎？
一切，都是謎底啊。