1689年，塞勒姆鎮被容許建立自己的教堂。前商人薩米爾帕里斯成爲牧師。1692年2月，帕里斯牧師9歲的女兒貝蒂和外甥女阿碧歌得了一種奇怪的病。她們開始呈現昏睡狀態。姑娘們發出尖叫聲，亂扔東西。有時身體抽筋併發出痛苦的呻吟聲。接着，其他女孩也出現同樣的症狀，恐慌籠罩了整個小鎮。
帕里斯牧師請來醫生格里戈。醫生診斷說，這些女孩受到巫術的蠱惑。幾個牧師來到小鎮爲病人祈禱，沒有任何效果。於是牧師們要求女孩必須指出哪些是使用巫術的人。當時人們普遍認爲:惡魔是通過一個人傳遞到另一個人的。也就是惡魔必須讓一個人充當它的代理人。惡魔便以代理人的面目出現去傷害他人。幽靈只有受害人看得見。正是這種“幽靈證據說“被法庭所接受。一開始，女孩們指出三個女人是女巫:女奴題圖巴;薩娜古德，一個女乞丐;薩娜奧斯本，一個與契約勞工結婚並很少參加教會集會的女人。
到了1692年5月，塞勒姆鎮和波士頓的監獄裡等待審判的巫術嫌疑犯人是人滿爲患。大約有200多人被指控使用巫術罪，其中女人多於男人。隨着女巫案情不斷擴大，有些人開始懷疑這些女孩指控的真實性。在1692年的夏季，6個女巫的絞刑並沒有使馬薩諸塞地區的女巫審判案終止。愈來愈多的人出現病魔折磨的症狀，於是對女巫的指控和審判也來愈來愈多。不論貧富，農民或商人均有人被指控。沒有人能夠倖免被指控爲巫術師。
在強大的輿論壓力下，菲普總督與於1692年10月29日下令:除非萬不得已，不得關押巫術嫌疑犯，並不要傷害任何在押的嫌疑犯。10月29日，他又下令解散特別審判法庭。1693年1月，最後一場審判巫術的案件結束。1693年5月，菲普總督大赦所有在押的巫術嫌疑犯並終止所有的審判。截此爲止，塞勒姆女巫審判案已使得19人被處以絞刑，1人被石頭堆壓死。
然而事實上，以上只是美國官方的記載，實際死於這次事件的人高達數百人。