有病人家屬來找程勇，說他的母親吃了印度格列寧以後出現惡化症狀。經過一番調查，程勇發現有其他人在賣印度格列寧，那就是做了多年假藥販子的張長林，他們發現張長林賣的印度格列寧是真的“假藥”，相當於是用麪粉做的，吃不死人但吃了沒有治療效果。
五人團隊有四個人深受白血病折磨，看不下去這麼多病友被騙，大鬧會場。最後，大家都進了派出所。
印度格列寧在市場上大肆流通，引起了正版格列寧廠商的注意，他們報案，因影響比較大，案件移交到了刑警隊，由程勇的前小舅子曹斌負責。曹斌在調查印度格列寧，藥販子張長林也在調查印度格列寧。雖然五人團隊還算謹慎，但是大藥販子畢竟是混跡藥物界多年，很快查到了程勇。
張長林舉報程勇，然後又給程勇通風報信，通過警察的手震懾了一番程勇。程勇的經濟危機已經解決，在張長林的威逼利誘之下，把印度格列寧的渠道以兩百萬的價格打包賣給了張長林。
在散夥飯上，其他四個團隊成員對程勇的行爲表示了鄙視，離開了程勇。
故事告一段落。
轉眼已是一年後，程勇拿了錢開了一個服裝加工廠，對客戶卑躬屈膝，阿諛奉承，像千千萬萬個小生意人一樣。程勇開着豪車正打算陪客戶去吃飯休閒，呂受益的妻子來找他。原來張長林拿到印度格列寧的渠道後，爲了攫取暴利，把藥的價格漲到了兩萬一瓶，呂受益買不起藥，病情又惡化了，頭髮稀疏，神志不清。
看到昔日團隊成員變成這樣子，程勇也很難受。呂受益死了！
事實上，此時此刻的程勇和此前的程勇已經完全不同。
他不再是此前急需用錢給父親治病的那個絕望的男人了，所以，他其實大可不必急需賣“假藥”。
但是呂受益的死卻給了他很大的觸動！
經過一番思想鬥爭，程勇又跑了一趟印度，但是時局不同往日，印度仿製藥廠被正版格列寧告上了法庭，被印度政府勒令停產，所以也沒有格列寧了。但是藥廠經銷人員表示可以從市場上回購一些藥品，以供應給程勇。
影片的高潮即將來臨！
和第一次賣藥不同的是，這一次程勇不再是爲了錢，而是爲了那些病人，爲了呂受益！
拿到藥品的程勇讓劉思慧告知各病人，以500塊的倒貼價供應給各白血病人，一條條QQ羣信息在華國的各個角落傳播，那些買不起正版格列寧的病人們拿到了他們的救命藥。同時，印度格列寧的重新出現讓正版廠商給了警察局更大的壓力，警察在死命的追查“假藥”的源頭，收繳“假藥”，低價拿到印度格列寧的病人們也在死命的保守秘密，不把程勇供出來。
看到這裡，路聲沉默了！
很多媒體人都沉默了！
誰之過？
就像此時此刻的曹斌一樣，一邊，他同情這些人，特別是病人老奶奶對着警察說，“我吃垮了房子，吃垮了家人，可我還是想活。”
曹斌迷茫了！
一邊他是執法人員，賣假藥無疑是違法的。
可是病人們就錯了嗎？他們只是想要活！
那麼藥商錯了？
每年那麼多的研發費用，動力是什麼？是爲了研發出新藥賺錢，如果不賺錢，他們會去投入那麼多研發新藥？
曹斌和局長的對話，充滿了對現實的無奈和迷茫！
張長林被抓了！
但是他卻沒有供出程勇，讓很多人想到了此前張長林對程勇說的那番話。
“這世上有一種病是你治不了的，窮病！”
《我不是藥神》的主題，在這個時候，其實就已經凸顯出來了。
任何人對他人的幫助都是有限的，從成本價賣藥開始，程勇就已經開始做出超出人性自私天性的行爲了，這也是用“神”形容的特徵之一，到後來倒貼賣藥救人的行爲更甚。可天價藥的不合理，普通家庭承受能力的問題不是通過個人的善舉就能解決的。
解救衆生是神的事，但希望能救一個是一個。這裡是最符合英雄色彩的一筆吧。
因爲警方追查的越來越緊，所以，程勇只能偷偷摸摸地打一槍換一地。
但是還是被警方查到了！
在貨場裡，程勇和黃毛正在接收新到的印度格列寧。警方收到舉報，派了大批警力圍堵他們，黃毛爲了掩護程勇，開着車衝開警車的層層圍堵，但是卻在馬路上被大貨車撞上了，搶救無效。
黃毛的死並沒有打消大家的鬥志，爲了廣大病人，依然賣印度格列寧。
程勇難道不知道自己會被抓嗎？
答案是否定的，他其實早就知道，這樣下去，他只有一個結果，但是他依然選擇繼續。
哪怕是他被抓了，頭被按在地上的時候，他並沒有太大的反應，可是當那些格列寧被警方搜出來之後，他卻徹底地崩潰了！
在程勇從法院被送往監獄的時候，廣大病友們在街
道兩旁密密麻麻站成兩排，目送法警的車輛緩緩前行。
看着病友們一個個摘下口罩，現場頓時瀰漫起一股霧氣，啜泣聲不時地響起。
字幕顯示，影片取材於真實故事，影片中的特效藥以納入中國社保名單，患者可以以較低價格服用此藥。
放映廳內，沉默了幾秒鐘之後，轟鳴般地掌聲響起，整整持續了好幾分鐘。
《我不是藥神》的大規模點映，場場爆滿。
觀衆口碑更是好的無以復加。
媒體，影評人都同樣的對這部影片讚譽有加！
“最大的病，其實是窮病。真的被感動了，整體都很成熟，也有些許韓片的影子。幾個演員表演都非常出色。可看性和內在的表達都不錯。這個世界最荒誕在於，越貼近真實，真實越荒誕。人這一生，太不易了。”
““你敢保證你一輩子不得病？”純粹、直接、有力！常常感嘆：電影只能是電影。但每看到這樣的佳作，又感慨：電影不只是電影！由衷的希望這部電影大賣！成爲話題！成爲榜樣！成爲國產電影最該有的可能。”
“前半段笑，後半段哭，每個人物都有血有肉，每一個角色都讓人難以忘懷，這是我今年看過的最好的一部影片！”