木葉根組織的一處陰暗的地下室中，被認爲已經被魂葉刺殺掉的團藏此時正躺在一張牀上，雖然他此時身體與臉都少了一塊，僅存的大半張臉更是臉色蒼白，但他卻依舊頑強的活着。
團藏此時雙眼滿含仇恨的盯着漆黑的屋頂，就彷彿將他傷害成這樣的魂葉就在他面前一般。
“團藏大人，你真的要進行初代細胞移植嗎？要知道這項技術目前還不成熟，可是有着很大的風險的，搞不好的話，你僅剩的這一點身體說不定就會被初代細胞徹底吞噬，到時候你…”就在團藏陷入仇恨之中的時候，一道沙啞的聲音突然從一旁響起，然後一道身影緩緩從黑暗中走出。
這個身影正是在團藏的幫助下一直潛心進行試驗研究的大蛇丸，而此處正是他的一處實驗室。
“不用廢話了，開始吧，相比於做一個廢人，就算成功機率只有百分之一、千分之一，我也要賭一把。”團藏此時猶如一個窮途末路的賭徒，臉上帶着瘋狂之色說道，這與他平時陰森沉穩的性格相差甚遠，顯然是魂葉此次對他造成的傷害已經擊垮了他的內心，讓他陷入了徹底的瘋狂。
“呵呵，既然如此，那你就只能期盼好運能夠降臨到你的身上了。”見到團藏瘋狂的樣子，大蛇丸也不再廢話，偷偷舔了舔自己的嘴脣，眼中露出一絲興奮之色，立馬開始了給團藏進行初代細胞移植的手術。
大蛇丸此次給團藏進行的初代細胞移植手術與之前進行的幼兒細胞移植試驗不同，這次只是將初代的細胞培育成指定的一部分肢體，然後在將這部分肢體與人體進行縫合。
雖然在這個過程中依然會有一些細胞排斥反應，但卻不像直接種植初代細胞那麼危險，手術成功的機率相對要高很多，而這種移植雖然也能獲得一部分初代的力量，但卻有很大的弊端，那就是力量極難控制，一不小心仍會遭到初代細胞的反噬。
許久之後，大蛇丸成功完成了手術，然後放下手中的工具，目光興奮的看向團藏身上那一塊與衆不同的軀體，慢慢欣賞着自己的傑作。
“終於完成了，太棒了。”大蛇丸讚歎道。
“這就是初代的力量嗎，我現在已經感覺到這支手臂中那無窮的力量！”團藏睜開眼睛，緩緩擡起自己新的右臂，如同欣賞珍寶一般打量着這支手臂，臉上不禁露出興奮的笑容。
興奮之下，團藏竟然忍不住向右臂注入了查克拉，想要試一下新手臂的威力。
就在此時，團藏右臂突然開始詭異的抖動起來，皮膚上不斷鼓起一個個大包，就彷彿其中蘊含着力量要爆發出來一般。
“怎麼回事？！”團藏努力用左手壓着暴走的右臂，慌張的喊道。
“放輕鬆，不要將查克拉輸入到這支手臂中！”大蛇丸連忙喊道。
聽到大蛇丸的話後，團藏立馬收起全身查克拉，努力讓自己平靜下來，而隨着他的查克拉停止輸送，他的右臂很快就恢復了平靜，重新恢復正常的樣子，就彷彿剛纔那一幕只是夢境一般。
恢復平靜後，團藏心有餘悸的打量了一眼自己的右臂，然後皺着眉頭向大蛇丸質問道：“如果每次向這支手臂輸入查克拉都會產生這種效果，那這種力量豈不是根本無法用於戰鬥？”
“呵呵，初代的力量豈是那麼好控制的，我現在只能將力量賦予你，至於如何控制這力量，那就要看你自己的本事了。”大蛇丸淡笑道。
“哼！”團藏冷哼一聲，只能暫時接受了大蛇丸的說法，然後便要起身離開這裡。
“團藏大人，如今不但漩渦一族的封印術沒有得到，還失去了魂葉君這一大助力，不知接下來你要怎麼辦？”見到團藏要走，大蛇丸突然開口問道。
“輪迴魂葉...漩渦一族...”
聽到大蛇丸的問題，團藏腳步一頓，嘴上喃喃道，思考了一瞬，他繼續沉默着向外走去，不過在他即將離開實驗室的時候，他的聲音卻遠遠傳來。
“你就安心繼續你的研究吧，其他的事情我都會搞定的。”
“呵呵，那我就等您的好消息了。”大蛇丸淡淡一笑，然後轉身繼續他的研究事業。
大難不死後的團藏性格變得陰沉了許多，半邊身子纏繞的繃帶不但遮住了他的初代細胞，也似乎遮住了他的內心，傷勢好了之後，他幾乎整日都是藏身在根組織之中，所以除了木葉一小部分高層外，大部分都不知道團藏其實還活着。
而團藏目前最急迫的事情就是報復魂葉，但魂葉離開木葉後就渺無蹤跡，他根本無法尋到報仇機會，於是他的怒氣就轉移到魂葉的親朋好友身上，不過魂葉的家族是輪迴一族，木葉的旺族，在浮瑩的守護下他也不敢肆意妄爲。
所以他便將目標鎖定與魂葉有着深深羈絆的夥伴身上。
魂葉最重要的夥伴是朔茂和田井，田井什麼宇智波一族的族人，也不方便下手，於是朔茂就成爲了團藏的目標。
團藏的目標不是直接殺害朔茂，而是想通過打壓他來逼迫魂葉現身，於是團藏開始頻繁給朔茂派遣一些高難度的任務，並且還讓人從中作梗，期望能通過讓朔茂完不成任務來打壓他的聲譽，然後讓他成爲木葉中受人唾棄的存在。
雖然團藏的手段都很陰狠，但怎奈朔茂的實力太過強大，每次不但能夠化險爲夷完成任務，還能夠很好的保護同伴，最終這些手段不大沒有打擊到朔茂的聲譽，反而還讓他的名號變得越發響亮，甚至都開始在木葉中產生讓他成爲下一任火影的呼聲。
屢屢立下大功的朔茂還得到日斬的賞識，被賞賜了一個火影袖，以裱他的傑出貢獻以及強大的實力。
另一方面，團藏雖然用盡各種辦法想要得到漩渦一族的封印術，但漩渦一族自從被滅國後，不但提高了對家族資料的守護強度，也對其他人產生了很強的戒備心，不再像以前那麼好說話，任憑派遣任何人用任何理由都無法借到一份封印術。
處處碰壁之下，團藏的內心越發憤怒和瘋狂，甚至又想密謀一個大的陰謀覆滅漩渦一族，但自從魂葉叛逃事件後，日斬就加強了對團藏的監視，所以團藏此時處處受制與日斬，很多陰謀都無法施展，只能一個人躲在暗處不斷策劃新的陰謀。