這個世界存在着某種與科學相關的異能法則，以此法則爲探索目標，人類創造出調用地殼能量的【鍊金術】以及調用地脈能量的【煉丹術】。
正常情況下，此異能受多種因素制約：其一、特定的圖案，想製造不同的異象需要不同的圖案；其二，擁有與煉成陣對應的科學知識，無法理解該物質的構造、分解、再構築的人，就算有煉成陣也無法引發異象；其三、等價交換法則，無法無中生有，一份質量的物體只能產生同樣一份質量的物體；其四，使用者自身的某種力量，會將水煉成冰的人一大票，世界的能量就在腳下，但沒有誰能夠調用整個星球的能量、將大海全部變成冰。
非正常的情況也是存在的，這個世界已可使用‘靈魂’的能量。接觸到靈魂層面的探索者將從世界深處領悟到更深層次的法則，可通過‘雙掌合攏’省略煉成陣的繪製；若是將大量的靈魂視爲消耗品，還可以無視等價交換法則，進行無中生有的煉成或非物質層面的煉成。
而正是某次非物質層面的煉成，給世界帶來長久的隱患。
古代王國賽爾克塞斯王室爲求長生不老之道，以奴隸-霍恩海姆的血爲基礎材料，犧牲多名其他奴隸煉成出【燒瓶中的小人（簡稱‘阿神’）】。阿神爲了得到自由，唆使王室在國內畫下國土煉成陣並在五個地方進行大屠殺，將自己和霍恩海姆的身體一起煉成爲由高密度靈魂組成的【賢者之石】。
得到自由的阿神並不滿足於此，他還想得到神的力量，成爲完全的存在。他把自己的傲慢、嫉妒、暴怒、懶惰、貪婪、暴食、色慾分離出來製造【人造人】，驅使能力各異的孩子們暗中建立亞美斯多利斯國並持續擴張。
如今亞美斯多利斯國總人口已超過當年的賽爾克塞斯王國，阿神的計劃步入後期，一邊讓【懶惰】在地下挖掘國土煉成陣，一邊讓時任總統【憤怒】發動侵略戰爭，打算以伊修瓦爾族人的鮮血作爲國土煉成陣的五大印章之一。
然而——
（嘭！）未來將更名爲‘斯卡’的武僧闖入地下室，即將解救改變這場戰爭的走向的男人。
“……好吵啊，外面……”因爲褻瀆地神-伊修瓦爾神而被身爲族長的祖父下令關押一年之久的萊爾，雙手分開被兩條鐵鏈吊着，垂着腦袋坐在地板上，似乎剛睡醒的樣子。
“萊爾，大哥說你是族內最強的戰士，我們需要你的幫忙！”斯卡拿着以違規手段得來的鑰匙，給萊爾帶來久違的自由。
他沒有防備萊爾偷襲，說到底萊爾也沒幹什麼傷天害理的壞事，只是不信奉全體伊修瓦爾族人都信奉的地神，而他剛好是族長一脈的子孫，族長爲了作表率不得不從嚴處理。
“大哥……？啊，你好像是小近的傻大個弟弟。”斯卡的大哥是個沉迷鍊金術的近視眼，是萊爾入獄前唯一的男性朋友，因這層關係，他入獄前其實是見過斯卡數次的，“所以，你們正在打仗？”
不是‘我們’而是‘你們’，一年的牢獄之災讓萊爾的態度發生改變。
“你連亞美斯多利斯正在攻打我們都不知道？”斯卡瞪大雙眼。
萊爾揉揉手腕，站起身來，嘲弄地說道：“畢竟我只是一個囚犯，一個褻瀆神的罪人，你們沒有一把火將我燒死已是寬宏大量，哪敢要求你們每天將時事新聞念給我聽啊。”
“…………”斯卡啞口無言，知道自己問了個蠢問題。
“老實說，我挺想將家裡的老傢伙們全部弄死的，完全沒有動力爲保護向我丟石頭的族人而戰。”萊爾活動了下身體，緩緩走向通往地面的樓梯，“只不過，看在你和你哥釋放我的情面上，僅此一次的參戰吧。”
斯卡腳步略微一滯，萊爾的發言讓他感到很不安，但一想到每天都有族人死亡，戰爭的勢頭越來越不利，血氣方剛的他馬上拋開疑慮，跟隨萊爾走出地下室。
“唔~~！陽光和清新的空氣~！”無視遠方的槍聲和硝煙，萊爾只想高歌一曲讚頌自由的美好。
斯卡很不體貼地打斷時隔一年重見天日的萊爾的好心情，催促道：“戰場在那邊！”
“別急，就算不給我吃飽喝足的時間，也給我點戰前準備時間。”萊爾沒好氣地搖搖頭，旁邊隨便找了塊小石頭，蹲在地面繪製出一個構圖相當複雜的煉成陣。
斯卡在旁默不作聲地看着，他平常經常看老哥繪製這些玩意，知道鍊金術師的戰鬥方式與常人不同。
“呵~不知道這算不算人體煉成呢~”萊爾淡然一笑，隨手拋開簡陋而實用的繪圖工具，雙手印在煉成陣上。
（滋滋滋）煉成的白色電光跳動着。
地殼的力量進入萊爾的身體，全身皮膚的色素分佈調整。在膚色變得白皙，失去身爲伊修瓦爾人‘紅色的眼睛’、‘褐色的皮膚’、‘白色的頭髮’三大外貌特徵之一的同時，全身上下滿布類似紋身的黑色線條和圖案。
“跟大哥的手臂相似的東西……？”斯卡在親人身上看過類似的東西，不同之處僅在於他的大哥是真正的紋身，而萊爾是在煉成自己的身體。
附帶一提，因爲某些原因，萊爾很難達到‘觸犯鍊金術禁忌’的標準，最起碼不是調整色素分佈的小煉成就能抵達真理之門。
“哦~他也覺得畫煉成陣很麻煩嗎？有空可以去看看他的煉成陣畫得怎麼樣，但現在——”萊爾一跺腳，身上的一部分黑色線條和圖案發出電光，煉成的電光於腳下大地亮起，並一直傳導至遠方。
（隆隆隆）地動山搖，高聳而厚實的石制城牆緩緩升起，將伊修瓦爾族人生活的這片土地圍在裡頭。
“什、什麼！？”斯卡雙腳一軟，跌坐在地上，他面上的震驚也不知道是因爲那些城牆還是因爲萊爾。
“沒必要這麼驚訝，這不就是你將我釋放出來的原因嗎？”萊爾身上另一個部分的煉成陣發出電光，數十米開外的一棵樹被某種力量扯了過來，其一部分樹葉、樹枝、樹皮煉成爲衣服、褲子、鞋子。
連換衣服的功夫都省了，在地下室裡穿了不知道多久的那身衣服直接分解掉，新衣物直接煉成在身體上。雖然材質不怎麼樣，穿着也不舒服，但好歹乾淨齊整。
“那麼……”萊爾轉過身，走向戰場所在的方向，輕笑道，“讓我看看正統的鍊金術師，跟我這個鍊金術和煉丹術雙修的自學者，有什麼不一樣~”
最終，阿神的計劃成功推進一大步，伊修瓦爾地區染滿了鮮血。
只是人造人們的劇本是【紅蓮之鍊金術師-金布利，以賢者之石的力量屠殺伊修瓦爾人】，而現實的發展是【現人神-萊爾，屠殺亞美斯多利斯軍人，紅蓮之鍊金術師-金布利以賢者之石的力量爲敗軍撤退爭取到時間】。