這時的朱由校，還沒有被祖父萬曆帝立爲皇太孫，也沒有被父親泰昌帝立爲皇太子，更沒有出閣讀過書。萬曆帝在世時，他始終不肯立這位長孫爲太孫，也不肯讓長孫出閣讀書。直到臨死前才留下遺囑：皇長孫宜即時冊立、進學。幾天以後，泰昌帝即位，冊立朱由校的儀式自然應該從皇太孫變爲皇太子。但是泰昌帝並不熱心冊封太子，後來在大臣的一再請求下，才下旨：“欽定冊立東宮，擇九月初九日。”但人算不如天算，九月初一日，泰昌帝竟然駕崩。朱由校皇太孫未做成，皇太子還沒來得及做，書本一天也沒正式讀，竟然要繼承皇帝大位。這樣的皇位繼承者，有明一代，僅此一人。
那麼，“移宮案”是怎麼一回事呢？“移宮”，按照字面理解，就是從一個宮殿搬到另一個宮殿，現在看起來很簡單，但在當時，卻是朝廷大事。“移宮案”，包括“避宮”、“移宮”兩個階段。
先說“避宮”。話還是得從朱常洛說起。朱常洛有“東李”、“西李”兩位選侍。大家知道，後宮裡頭有皇后、皇貴妃、貴妃、嬪等等，選侍是比較低級的妃子。天啓皇帝朱由校的母親生下他之後不久就死了，朱由校及其同父異母五弟朱由檢，託付給西李選侍照管。西李爲了控制朱由校，便要求他與自己同居一宮。後來天啓帝說：“選侍凌毆聖母，因致崩逝”，後“選侍侮慢凌虐，朕晝夜涕泣”。泰昌帝即位後，朱由校和西李隨之移居乾清宮。西李得寵於泰昌帝，泰昌帝打算將她由選侍封爲皇貴妃，但西李要求封爲皇后。不久，泰昌帝駕崩，西李封后的夢想破滅了，便勾結心腹宦官魏忠賢，想利用朱由校年少，自己居乾清宮，覬覦垂簾，把持朝政。楊漣等到乾清宮哭祭，乾清宮門關着，大臣們排闥而進，閹宦揮梃亂打。諸臣強入，哭臨之後，請見皇長子，皇長子被西李選侍阻於暖閣。大學士劉一燝(zhǔ)、吏部尚書周嘉謨、兵科都給事中楊漣、御史左光斗等，疏請西李選侍不能與太子朱由校同住一宮，但西李選侍不肯移宮，甚至把朱由校禁閉在乾清宮。司禮監秉筆太監王安乘西李不備，將朱由校搶抱出，魏忠賢等太監追出來。朱由校的衣袍都被追趕的太監撕壞了。閣臣劉一燝掖左，勳臣張維賢掖右，共擁朱由校登輿，擡到文華殿。西李派人來請朱由校回乾清宮，大臣們又把朱由校安排到慈慶宮。朱由校就這樣擺脫了西李等人的挾制，逃出乾清宮，住進慈慶宮。這件事情史稱“避宮”。
再說“移宮”。朱由校避住在慈慶宮，西李卻“居乾清宮自若”。而朱由校(天啓)要登臨大位，就必須回到乾清宮。爲了讓西李儘快“移宮”，兵科都給事中楊漣、御史左光斗等多次上奏，朱由校(天啓)猶猶豫豫，反覆無常，最後才於九月初五日下令：“先帝選侍李氏等，着於仁壽宮居住，即日搬移。”西李選侍還是賴在乾清宮不搬。據《明史·方從哲傳》記載：“……於是，議移宮，爭數日不決。……至登極前一日，(劉)一燝、(韓)爌邀從哲立宮門請，選侍移噦(hu-)鸞宮(明代宮妃養老之地)。”而皇長子朱由校(天啓)也從慈慶宮回到乾清宮。
這就是“移宮案”。
“明宮三案”——梃擊案、紅丸案、移宮案，牽涉到萬曆、泰昌、天啓三代皇帝，但是以朱常洛爲軸心人物。“梃擊案”梃擊的就是太子朱常洛，“紅丸案”吃了紅丸的也是朱常洛，“移宮案”則是朱常洛的寵妃西李選侍居佔乾清宮。大家可能會說，這三個案子就是皇帝家裡頭的事啊？但是，皇宮無小事，這三樁案子的意義早已超越了“宮案”本身。因爲：
其一，“明宮三案”影響朝廷決策。“三案”將朝廷注意力吸引到宮廷鬥爭。《明史·后妃傳》記載：“羣臣爭言立儲事，章奏累數千百，皆指斥宮闈，攻擊執政。”因之，朝廷不能將注意力集中到國家大政、要政上，諸如關外的遼事等，致使許多重大問題或束之高閣，或拖而不決，或決策草率，或決而不行。
其二，“明宮三案”加速宦官專權。《明史紀事本末》記載：“魏忠賢殺人則借三案，羣小求富貴則借三案。”明末宦官魏忠賢專權，閹黨跋扈，使本來、黑暗的明末統治更加、更加黑暗。
其三，“明宮三案”成爲黨爭題目。明朝後期，有東林黨、浙黨、楚黨、宣黨、齊黨等等，這些黨與我們今天意義上的黨不同，他們沒有綱領，沒有組織，是一些學人、官員組成的一個鬆散的羣體。“明宮三案”就成爲黨爭的題目，比如說李可灼進紅丸這件事情，方從哲他們說李可灼沒有罪，他給皇帝治病應當賞銀；東林黨人則說，泰昌帝的死主要就因爲吃紅丸，李可灼有不可推卸的責任。後面要講到的熊廷弼，他的三上三下、傳首九邊，都同朝廷黨爭有着直接的關係。
在明朝廷“宮廷三案”鬧得烏煙瘴氣之時，正是努爾哈赤建元、興兵——下撫順、清河，薩爾滸大戰，又連下開原、鐵嶺的時期。努爾哈赤看準了時機，繼續嚮明朝遼東重鎮瀋陽與遼東首府遼陽發動進攻。