既然已經稱王建制，那相應大都督府的架構和名稱也要有所變化和調整。在整體編制基本不變的情況下，十三判曹升格爲十三分司，主官依舊稱判事，佐副爲左右判；各曹主官則爲的參軍、左右參，各科負責人則爲相應的主事、從事職銜；分別隸屬於政務官的初階和事務官的中階。
就此形成大都督府內判司——分曹——科房三級直屬部門體系，在科房以下又按照需要別設有若干臨時性的小組，以抽調人員完成短期或是中期內的的業務需要。除此之外又有若干局、所、院、監、署等，低於判司或是分曹的附屬小部門，負責人稱爲從事或是官正，以掌握特定領域的庶務和技術。
通常情況下，十三判司長官外加特定人選組成的定期政務聯席會議，以及相應部門組合溝通協調的日常碰頭會，就足以決定管轄下的大多數相關事務。只有政策、方針、指導性質的內容和重大事項的運作，纔會交付到周淮安的面前來，由相應的三參團組負責審覈，再歸總於周淮安最終批覆刊行。
其中能夠參加的特定人選，就是以所在部門本職加左右參議、左右參政四級頭銜，而得以參加相應議題的表決資格；區別的是前者只有表決權和異議權，而後者更擁有提案權。類似於過去歷代朝廷的錄尚書事、參知政事、同中書門下三品、同平章軍國事等等；
主要是爲了確保最高統治者，隨時有對最高層面的統治機關和決策部門，進行摻沙子和改變權力制衡、調理派系力量對比的權力；以避免其中因爲相應人等的長期掌權和機構運作過程當中，天然形成的山頭和派系，把持或是壟斷某項事務或是整體局面的可能性。
因此，相對於目前大都督府還算是比較簡明的行政體系，待到日後相應的職責和組織進一步擴大，正式撤銷都督府的名頭而轉入國家政權層面之後；還會加上若干見習參議和聯席會議行走的頭銜。前者作爲有資格旁觀和見證，高層決策過程的榮譽頭銜和資格；而後者則是在場負責相應準備工作和記錄過程等庶務。
作爲唯一的最高統治者，主要掌握住基本的軍權、人事和財政權，其實次外交、情報和監察權；其他的完全可以委託給一個運轉良好的官僚體系，而只要注意時不時的予以鞭策和刺激，替換掉以及老朽腐壞的零件，以實現及時更新換代的良性循環而已
而在在地方上，依舊還是屯/鄉三長（司庫、巡長、主辦）——縣三官（縣尉、縣丞、典史）——州三佐（司馬、別駕、長史）；只是在四道十路的路一級，預留了相應“三司四使”和若干別設、差遣職的位置和相應等級的晉升空間。
即（內地）布政使/（延邊）安撫使、（財賦重心）轉運使/（普通分路）度支使、（望要區域）按察使/（普通地方）提刑使三大司；足以掌握和維持住一路下轄的十餘州到二十餘州，匯聚起來的大多數行政體系運作需求。
又有（望要重點）巡察使/（邊遠地區）採訪使、（人口密集）學政使/（人口稀疏）提調使、（內陸）營田使/（邊疆）墾拓使，營造使，等四位次一等的使職；負責分理監察採風、宣教文選、軍民屯墾/農漁林牧、工（廠）礦（山）運營等重點事務。
在路與州之間，又有按照實際需要別設的經略使（戰備），戍防使（守邊）、鎮平使（平叛定亂）或是討擊使（局部攻略）等，非定額編制的臨時職事差遣。與之對應的軍隊體系當中十二軍序，以及從（士三階）火長到（將八階）首席中郎將的配套職階、軍銜基本不動；
但是在一州內委派用兵時，會特任加銜爲兵馬使/守捉使，數州範圍內的用兵主官稱都兵馬使/統將，專掌一路用兵的主官稱制置使/都統。。一旦將來還有橫跨數道的大兵團聯合作戰的需要，則負責總籌局面的主將、副將，則加上相應地域特色的（正副大中小）都督、都護銜以專其事。
而二三線的地方守備序列則又是另一套體系。主要在州城和縣下一級，自有相應城內的守備團和市鎮中半脫產的巡護隊；在重點大州或是名城望要大邑內，還有若干的駐隊營作爲二線守備力量。
在日常勤務上從屬各級地方官府的調遣和指派，並提供福利津貼；在考績和人事升遷上受到大都督府虞候司節制；而軍事訓練裝備糧餉，則有兵曹守備科進行管理。這樣一旦遇到戰事和變亂、暴動時，則有委派的將領負責具體指揮，或是統一歸在相應轄區內的戍防使、經略使、鎮平使的麾下作戰。
因爲日後的電報線路的鋪開和蒸汽車船水運延伸的預期治下，在內陸和大後方地區的三司四使，除了本衙的護衛隊和擁有一定武裝的諸多役屬之外，也不再沾手任何軍隊相關的成分。但是對於分路內駐留的（直屬機動部隊）十二軍司之一，在突發事件和應急處置上有權要求協力，並擁有相應的監督和彈劾權。
因此各種名稱大多數還是古代版本的，但是實際內容已然是大相徑庭的產物了。反正就是吸收了相對成熟的古代體制之後，加上現有新事物的需要和明確發展方向，而逐漸延伸出來的四不像產物。主要是爲了政權體制將來的發展方向和人員晉升的空間，創造足夠的餘地和上限來。
這一切其事早已經在私底下醞釀好大致構架了，只是趕上這次進奉王號的需要，才得以被拿出來作爲後續的建制需要。事實上，如果有可能的話，周淮安還想放到正式進入中原，並且佔據了兩京之一的統治權和宣稱權象徵之後，再給拿出來刊發的。
因此，雖然宣稱王號了，但是後續的事情還有很多，足夠讓大都督府上下忙碌上好一陣子了。相對諸多忙着銷燬和重新制作印信、刊頭和制式便箋的內部人員。外間對於太平軍之主稱王而立年號、定章程制度的反響，就要更加強烈的多了。
那些原本就被派駐在江陵城中的各方勢力代表和使者，幾乎是走馬燈一般絡繹不絕的遞上請求覲見和道賀的帖子；而讓原本隆冬時節寒冷肅殺的天氣下，都似乎變得有些熱火朝天起來了。此外稱王建制對另外一些人而言，也終於迎來了夢寐以求的變化和轉機。
比如，而昔日大唐的內碣者監穆好古，在寫了不知道多少萬字的陳情、自省書和大內回憶錄，又不知道做了多少場現身說法的紀實報告之後；也終於得到了他夢寐以求的位置——楚王府所屬的行苑主事，而拉着另一位難兄難弟張承業，就此屁顛屁顛的連忙上任去了。
當然了，也有人就不那麼愉快甚至有些失落了。比如，在江陵城中正在收拾行裝的大齊新朝前兵部左侍郎、內軍容使，如今卻因爲在火器操演上除了大紕漏而，而被改任爲兵部庫部郎中、內杖庫使，派到南方來專事督促和協調器械纔買輸運的林言。
“內使這是打算起身回程麼？”
而剛剛從外鍵打聽消息回來的副手，長相年輕尤帶稚氣的曹純，順見到這一幕卻是驚訝道：
“這怎麼可能？北邊大雪封山的商洛道還是凍着呢？”
林言卻是自嘲的笑了笑：
“更何況，就算我想北歸，豈又是隨隨便便能夠歸還的了關中麼？”
“那。。。您這是？”
曹純順愈發的疑惑了：
“如今之勢，是我辦砸了差事，已經無顏再去面見升上。。又礙於身份所限，不能不對外有所表示。。。正當進退兩難啊！”
雖不過三旬保養還算得當，然而擡頭紋愈發明顯起來的林言，卻是愈發愁嘆道。
“好在那位還念舊情，也沒怎麼逼我表態，但是這江陵卻是再也待不下去了。。。”
“那您又打算何去何從。。”
曹純順亦是訝然道：
“南下廣府也好，東去鄂嶽、丹徒也罷；偌大的江南地界，那麼多的名城大邑，總有我一處的棲身之所吧。。”
林言意興蕭疏的答道：
然後，他又目光灼灼的看着有些目瞪口呆的曹純順道：
“當然了，你就不一樣了啊。。你可是中宮的親族啊！就算是我出走後，無論如何都不會牽連和罪及到你的吧！這可真是讓人羨慕啊。”
“我。。。可沒這個意思！”
曹純順不由漲紅了臉而張口結舌道：然而，就見林言又自顧自的的說道：
“我自然指導你不是這個意思。然而，你們曹氏一門可是接連出了兩任後宮當主啊！無論是大齊當下，還是太平軍治世，曹家可都是雷打不動的第一外戚之族；無論如何於將來也就是早早立於不敗之地了！”