果然，咸豐簡單地將李炎昌的事情來龍去脈說了一遍，隻字未提是從《南方日報》上得知，只是要求對李案進行三司會審，務必徹查，無論涉及到誰，均一律拿下，解送京師。
四人一聽皇上的話裡行間，頓時感到事發嚴重：皇上顯然掌握了案件的許多細節，從皇上的臉色和神情來看，顯然是憤怒到了極點，勉力壓制。
四人都在官宦生涯中沉浮多年的人精，對視一眼，便作出決定，必須完全按照皇上的意願辦理此案，先搞清楚原本事情的來由。但有一點，他們都明白，對於此案，各自都不能輕視，搞不好，連他們也搭進去。
於是，在大清三個最高級別的司法刑獄和監察的衙門調查運作下，很快，便趕至糊北黃州府，秘密地對李炎昌進行開棺驗屍，由於屍體早就全部腐爛，只得按先朝破案範例《洗冤錄》中蒸骨之法進行蒸骨驗屍。
但三司衙門會審，動靜很大，開封府早有人知曉，派人在現場想再次做手腳，但刑部調派部內的差人封鎖四方，開封府方面來人無法動手腳，只得派人回稟。
蒸畢一看，骨頭全黑了，李炎昌生前中毒之說無疑！至此，三司衙門確認李炎昌系被害而死。
蒸骨驗屍情況呈達朝廷後，李炎昌被人毒殺一案已經成立。
咸豐聞奏，立即命軍機大臣兼體仁閣大學士祁寯藻坐鎮督查該案，並由刑部、吏部、禮部、都察院一起負責查處、辦理有關涉案事宜，嚴防舞弊，更不得延誤。
於是，一張大網向菏南，尤其是開封府籠罩。
在此案調查期間，滎陽縣令王琨和開封知府賈臻如坐鍼氈，收了他倆錢的幾個大員也是寢食難安。
如此大的陣勢，此案勢必要被查出。先是王琨的師爺做賊心虛，主動至刑部投案自首。
接着，涉案人犯開封知府賈臻、滎陽縣令王琨以及滎陽縣的幾名衙役和牢頭，還有幾名街頭混混，都察院的二名都事，等都先後落網。
幾天內，全部人犯都押解到京師，交付刑部，分別收監候審。
經過堂審訊和當堂對質，一干人犯纔不得不吐露實情低頭認罪。
謀害李炎昌的元兇王琨，見內情徹底敗露，再無人能救，便原原本本地供出了侵吞賑災錢糧、行賄及害命的整個案情。
至此，李炎昌被害始末原原本本地呈現在咸豐面前。
這件事一查，不單單是謀害一個李炎昌以及他叔叔、妻子這幾人這麼簡單，還牽涉到背後龐大的貪腐官員羣體，一個龐大的貪賑集團。
單一個開封府，賑災的滎陽、汜水、滎澤、鄭州、密縣、新鄭、中牟、祥符八縣知縣有七個知縣存在貪腐情況，從最多的鄭州縣令侵吞賑災銀一萬五千兩，到汜水知縣侵吞災銀二千三百兩，只有中牟一縣因爲賑災銀只有三千兩，知縣爲人清廉沒有侵吞賑銀。
除開封府外，其餘菏南的衛輝府、彰德府、菏南府、汝州、許州、南陽府、陝州等州府，也是處處貪墨，府府侵吞賑銀，觸目驚心！
單菏南一省之地，分配的35萬賑災銀中，就有31萬兩被吞沒，加上正常的路耗和購糧損耗，真正用於賑災的，只有3萬餘兩。十不存一！
整個菏南官場，完全爛了。
咸豐徹底被激怒，大清官場的糜爛，菏南官員的貪腐，讓他徹夜難寐。
他當即連下幾道旨意。
一是算賬，所有跟本案有關的官員，從上到下，一個也不放過。
對於直隸總督訥爾經額，咸豐本就對其圍堵長毛賊北伐軍不順有些不滿。
新任的欽差大臣兼都統勝保，奔赴菏南圍剿長毛賊匪，一直苦於糧草供應不上，便上奏咸豐多次訴訥爾經額牽制太多，提供後勤不力。
如今再加上賑災滅蝗不力，現在又出了這麼一檔子事情，當下便下了狠手，將其革職，發往回疆效力贖罪。
對菏南巡撫英桂，咸豐對他印象還不錯，便從輕發落了，只是革職，降爲菏南按察使，並攤賠白銀二萬兩，罰俸三年。
而其餘的菏南布政使和按察使，因皆爲漢人，就沒那麼好運了。全部以賑災不力，玩忽職守之罪革職打回原籍，沒收全部家財收歸內務府的內庫，至於爲何不是戶部國庫，誰敢去質問皇上？
而對於幾名主要案犯，就不光是革職這樣輕鬆了。
第一個是開封知府賈臻：他收受主犯滎陽縣令王琨賄銀3000兩，明知王犯冒賑而不管不問，並夥同王琨與其他知縣，貪贓枉法，並且唆使手下行兇殺害前來查處的上級官員，其罪大惡極，按律例，判以刑挾一次，再行斬首。
第二個是滎陽縣令王琨：他冒領賑銀一萬三千兩，其入己之數達一萬兩之多，已屬法無可貸，且因此謀毒李炎昌斃命，實屬貪黷殘忍，莫此爲甚，着立即處斬，抄沒全部家產。
並且，咸豐深恨此人，立即處斬還不算，爲了解恨，將王琨之人頭用石灰醃製，懸掛於黃州府李炎昌墓前悔罪。而王琨的長子才十三歲，也被收監，待歲滿成年後流放新疆。
第三撥人是直接行兇的滎陽縣衙役和師爺、李炎昌隨從，李炎昌隨從已被害死，但滎陽縣衙役和師爺隨主查賑，膽敢貪利肆逆謀害上官，更兼殺人滅口，實屬罪盈惡極，均按‘僱工人謀殺家長、照子孫謀殺祖父母者，皆凌遲處死’律例，將這幾人全部各重責四十板再行凌遲處死。
特別是出主意害死李炎昌以及李叔、李妻的師爺和親手勒死李炎昌的一名衙役，咸豐敕令派刑部司官一員將兩人押赴糊北黃州府，於李炎昌夫妻的墓前凌遲處死，並挖出心肝祭奠英魂。
最後，其他的相關牽連人員，如菏南的衛輝府、彰德府、菏南府、汝州、許州、南陽府、陝州等州府知府和縣令，開封府的汜水、滎澤、鄭州、密縣、新鄭、祥符等知縣，全部革職查辦。
一時間，整個菏南官場震動，差不多整個菏南絕大部分的知府和一半多縣令被開革免職。要不是體仁閣大學士祁寯藻勸阻咸豐，如今長毛賊犯境，南方粵賊又四處出擊，中原腹地需要安定，照咸豐脾氣，便是將整個直隸、汕西等省要全部再清查一通，將這些貪官都革職法辦。
不過，氣不過的咸豐，雖然因爲非常時期不讓各省動亂，有些忍氣吞聲，但還是敕令中原受災的幾省，各道、州府、縣官員全體罰俸一年，以示警醒。
二便是是告慰，李炎昌幾乎受到了曠古未有的死後祭奠。
咸豐親自作詩嘉獎李炎昌爲“除殘警邪慝，示準作臣綱”的廉吏表率。
又請人鐫刻於石碑土，立於李毓昌墓前，並捐資一千兩修《憫忠詩》碑樓一座，以褒忠節。
並且，李炎昌親屬也要受到優待。
咸豐欽命，將李炎昌追封加賞爲侍郎銜，照侍郎例賜卹。並且，已經安葬了的李炎昌，挖出來重新下葬，新的葬禮按照三品官例給予全葬銀三百兩，一次致祭銀二十兩。
最後，給李炎昌的兒子恩賞爲舉人。
不過，最後一項，卻爲難了。刑部和黃州府的當地官員來報，聽說李炎昌的兩個兒子和老母親以及弟弟都被人接至南方。
咸豐這纔想起那個《南方日報》上說的，李炎昌親屬已經被南方的粵賊們接至茳西贍養起來，不由心裡大恨！此時就算獎善懲惡，他這做大清皇帝的亦臉上無光了。
於是，他再下旨意，封李炎昌兒子李希佐爲恩賞舉人。
黃州府的知府此時才明白，皇上的真正用意。連罵自己太笨，於是連忙在李炎昌老家，尋了一李姓年輕子侄，過繼給李炎昌爲子，取名李希佐，迎接皇上的封賞！
但李炎昌老家附近乃至黃州府周邊一帶的百姓，很快便知道了內情，隨之越傳越廣，糊北甚至菏南直隸一帶，都知道怎麼回事了。