馮雲山剛回到廣州城沒多久，便收到從芸南傳來的加急軍情快報。
去年底，李開芳率領甲二師一萬餘名將士，陸續佔領了芸南南部的廣南府、開化府、臨安府、芸南府，圍攻昆明城。
羅瓊樹率領甲六師和乙十七旅一萬六千人，陸續佔領廣西州、曲靖府、東川府、武定州和楚雄府等地，同李開芳合圍昆明城。
雲貴總督恆春和芸南巡撫吳振棫領兵一萬五千餘人，加上團練勇壯近萬，合計2萬五千人，緊守昆明城。同時，他們一方面向京師報急求救，另一方面，又向相隔數百里的大理城內的新任芸南提督文祥求援。
芸南提督文祥率領本提標兵和楚雄協，會同鶴麗鎮總兵領着八千餘清兵，剛從大理行軍至楚雄府，攻佔了被討虜軍奪取的楚雄府城，忽然大理髮生回民暴亂。
一名叫杜文秀的回民，在大理城南不遠的蒙化帶領一幫回民發動起義，攻佔了蒙化城，一天之內，大理府境內多處回民起兵響應，杜文秀率領近千名回勇前往大理，趁着大理城內的清兵空虛之際，與各路回民義軍一道，一舉佔領了大理城。
馮雲山看到這裡，不禁一陣苦笑！
這段歷史，他其實是知道的。只不過，這杜文秀率領的回民起義之事，好像提前了。而且，還因爲他的原因！
馮雲山仔細一想，還真是跟他下令討虜軍攻佔芸南，搶佔銅礦脫不開干係。
今年初，由於討虜軍一路攻佔芸南東邊的各州府，滇東各州府清軍紛紛逃往芸南府昆明城以及滇西的大理府等地，造成大理府境內等滇西一帶清兵流民爲患，本地回民與清兵的矛盾越來越大。
這便爲回民作亂起事提供了充分的土壤。
根據李開芳等人傳來的情報，加上自己知道的歷史情形，對於杜文秀此人，馮雲山已經非常瞭解。
此人回族富商家庭出身，他自幼勤奮好學，13歲即通曉儒家典籍，14歲考中秀才，16歲補廩膳生員。但在他22歲那年，他的老家永昌府保山縣發生了一起著名的“保山慘案”！
當時，保山縣城郊的一個村莊裡，有一回一漢兩個少年，唱歌互答，嬉鬧作樂，漢族少年的一句歌詞傷害到了回民的感情，兩人發生口角，接着打起架來。
這本是一件微不足道的小糾紛，但這一小糾紛被漢族的地主幫會勢力“香把會”利用，藉機火上澆油，激化矛盾，挑起了回漢兩族大規模的械鬥。接着械鬥升級，雙方互有傷亡，“香把會”頭目沈聚成手段越來越殘忍，組織人馬下令搗毀了回民的清真寺，放火焚燒了回民的房屋，乘機燒殺擄掠，回民死亡近千人。
緊接着，保山官府與“香把會”勾結，對保山城內的回民進行屠殺，四千多回民幾乎被屠殺殆盡。
杜文秀因在蒙化，躲過一劫，但他全家十五口在這場大屠殺中幾乎全部遇難，未婚妻也被縣令的兒子搶去。
杜文秀進京告狀，朝廷雖派林則徐來處理，卻輕輕放過，敷衍了事。而杜文秀反而因爲告狀，被芸南官府所記恨，將之陷害入獄。出獄後，太平天國起義爆發，隨即，南王馮雲山佔領兩廣，整個滿清風雨飄搖。杜文秀就此在蒙化暗自準備反清。
今年初，由於滇東的大部分州府都被討虜軍佔領，原本在滇東開採銅礦的漢族官商被迫遷移，逃至滇西等地，於是，多地發生漢紳霸佔回民銅礦的事情，漢回矛盾急劇惡化。漢族官紳都把持着地方的團練武裝，再加上與官府本又是一體，於是，各地漢族團練焚劫回民村寨，而云貴總督恆春也密令各地“聚團殺回”。
杜文秀一看起義時機來臨，加上大理清軍兵力空虛，便迅速發動起義。
佔領了大理城的杜文秀等回民武裝，聲勢浩大。他自號“總統兵馬大元帥”，下令廢除清朝年號，用甲子紀年，改用明朝衣冠，旗幟一律用白色，建立大理大元帥府。
短短二個月時間，杜文秀回民義軍便攻佔大理府、麗江府、永北廳、騰越廳、永昌府、蒙化廳、順寧府、景東廳等州府，回民義軍達到30餘萬。而且，還在不斷的增加。
芸南提督文祥來不及救援昆明城，率兵返回大理府，準備收復大理。不料，被人多勢衆的回民義軍團團包圍，被殺得慘敗，鶴麗鎮總兵也被擊斃，只剩下芸南提督文祥率領三千餘綠營兵逃回楚雄府城。
而這時，李開芳和羅瓊樹兩人正好率領討虜軍甲二師、甲六師一起近二萬餘將士圍攻昆明城。
城內的雲貴總督恆春原本是想據城堅守，盼望着芸南提督文祥率兵來援。這時發現文祥又被回民義軍擊敗，朝廷對整個芸南已經完全失去控制，他自知難以交差。即便堅守昆明不失，可作爲雲貴總督，芸南都幾乎全部被佔，他仍舊是死罪難逃。於是，猶如歷史上一樣，心理素質弱的雲貴總督恆春，在憂憤和絕望中和其夫人一道，上吊自盡了。
這時剩下的最大官員便成了芸南巡撫吳振棫。
羅瓊樹在信中道，這個吳振棫卻是六十四歲的老頭了，浙茳錢塘人氏，出任芸南巡撫二年來，禁止當地百姓種植鴉片，勸民種桑播谷，還修築橋樑，頗有政績，但因是漢人出身，一直被雲貴總督恆春壓制，空有抱負無法施展。
也許是官癮太大，還是真的怕死，亦或是恆春一死沒人壓制了，這個吳振棫竟然偷偷派人與羅瓊樹聯絡，說是他可以開城門投降。當然，他是有條件的。
羅瓊樹提到，吳振棫要求滿足他兩個條件，他便投降聖國。一是在他投降前將他在錢塘老家的家人全部接出，以免他歸順聖國後家人被清軍所害，而且，要求日後聖國佔領錢塘後他家的田產歸還給他。二是要求面見聖王馮雲山，他要親耳聽見聖王承諾他歸順聖國後，讓他繼續出任一省的巡撫，爲民謀事。
羅瓊樹和李開芳商量後，不敢做主，認爲吳振棫要求有些過份，便一邊將大理回民起義的消息稟報馮雲山，一邊將這個芸南巡撫吳振棫的事情讓馮雲山拿主意。
“這個膽小的老狐狸，讓我親口承諾他，不過是一個藉口，實際上，估計一是拖延時間，二是順帶看看本王的誠意吧！”馮雲山看完信報，輕笑起來，將手中的信報遞給身旁的左宗棠和王闓運。
兩人相繼飛快地看過，均是臉上一驚。
左宗棠首先開口道：“聖王，依屬下看，這吳振棫所說的，應該可信！不知道聖王注意到沒有，此人說的將其家人接走，並且等聖國佔領他老家後，將原本的田地歸還給他。能考慮這麼仔細，其人確實是真心想投靠聖國了，只不過又擔心，因此要聖國親自給他個承諾。”
“而且，從行軍打仗的角度來說，芸南山高林深，作戰困難。總參謀部接過幾次李開芳送來的軍報，說是那裡行軍幾位困難，都是狹窄陡峭的盲腸山道，火炮無法運輸，矮小的州府之城尚好，像大理、昆明此類堅城，恐怕難以用硬攻奪取。從方面來說，聖王，此昆明城，還是嘗試一番，您親自去一趟勸其歸降聖國。”
王闓運也附和道：“左副總參謀長所言甚是！聖王，屬下也覺得這吳振棫很有可能是真的想歸順我聖國！不如盡力爭取。一來，可以減少因攻打昆明堅城而戰死的討虜軍將士；二來，可以將這吳振棫作爲一具馬骨，千金換馬骨，給滿清的官員一個示範，這樣以後便會有更多的滿清官員歸順聖國，增強聖國的實力。而且，此人熟悉芸南，對於平定芸南其餘州府，穩定人心，都能起到很好的作用。”
聽到這裡，馮雲山心中已經有了主意。