這四個元軍殘餘勢力，"引弓之士不下百萬，歸附之部落不下數千裡"，還擁有大批的牛羊、武器裝備，戰爭潛力非常巨大。
元將王保保的傳奇擴廊帖木兒（王保保）是元末比較有名的地方實力派，他是河南沈丘人。今天，很多人知曉他要歸功於金庸的武俠小說《倚天屠龍記》。在該書中王保保是個非常忠於元朝皇帝的將領。在現實中也是如此，王保保對元順帝忠心耿耿，連朱元璋都稱讚他。元王朝是從蒙古高原上崛起的王國，元太祖成吉思汗幾乎是白手起家，依靠過人的才智，短短几十年內就成爲世界爲之顫抖的人物。因而，朱元璋非常害怕元順帝及其後來者，會像成吉思汗一樣在短短的時間內再次崛起。故此，攻克大都後，朱元璋立即決定兵分兩路乘勝追剿元軍殘餘勢力。明軍主帥徐達率一路出西安，主要目標是攻佔定西、臨洮等地，追擊盤踞甘肅一帶的擴廊帖木兒、李思齊等人；另一路從居庸關出發繼續追擊逃亡漠北的元順帝。出西安的明軍，於洪武二年三月攻佔鳳翔府，將盤踞關中的元將李思齊擊敗。李思齊一退數百里，逃到甘肅臨洮，觀望明軍進攻方向，同時擺出進入青藏高原的架勢。徐達和明軍各路將領商討形勢後認爲，臨洮是甘肅的軍事要地，如佔據臨洮明軍就可以奪取戰略上的主動，向西南可以取河湟，向西可攻河西走廊。於是，明軍在徐達的指揮下，一路西進，先後攻克隴縣、天水、武山、直抵鞏昌（今隴西），元軍守將不戰而降。隨即攻克定西，然後明軍分兩路進兵，馮勝率一隊人馬取臨洮；顧時、戴德率領一路進攻蘭州。此時元軍殘餘勢力已四分五裂，人心不穩。李思齊無奈投降了明軍，而蘭州也被明軍順利攻佔，佔據蘭州、臨洮後，明軍分兵進攻各地，陸續攻取會寧、靜寧、平涼等地。至此，蘭州及其周邊的大部分地區爲明軍攻佔，洪武二年九月，徐達、湯和等人率軍班師回南京。誰知明軍剛退，擴廊帖木兒就從河西捲土重來。蘭州首當其衝，被擴廊帖木兒的大軍團團圍住。
大戰沈兒峪蘭州守將張溫一邊堅守，一邊派人向朝廷求救。擴廊帖木兒兵力強大，不僅在今天蘭州白塔山東側的山上修築了王保保城，而且派出10萬人馬攻佔定西和蘭州間大片地方（即東崗鎮到榆中車道嶺一帶），切斷了蘭州和定西之間的聯繫，其時，黃河已經結冰，蒙古騎兵通過冰橋很自由地在黃河上來往。擴廊帖木兒（王保保）圍困蘭州後，爲了便於防守，除了在黃河北白塔山東側修築了一座城堡，又在東崗鎮一帶的山上修築了城堡。
面對西北地區嚴重的局勢，明政府再次出動大軍征討。此次，依舊是兵分兩路。徐達率鄧愈、湯和過潼關，大軍直逼擴廊帖木兒。李文忠、馮勝則出居庸，追擊漠北元軍。徐達率軍進逼定西，擴廊帖木兒（王保保）退守沈兒峪。沈兒峪當在今天定西和榆中交界處的車道嶺。車道嶺是平涼、天水通往蘭州的咽喉，是一條西北東南走向的黃土山樑，長約24公里寬約3公里，最高處海拔2457米，如今316國道由此通過。但是也有部分專家認爲，在今天的定西攙山口一帶。元明兩軍隔一條山溝對壘。這場戰鬥極其慘烈，兩軍一日發生數次大戰。一開始勢均力敵，不分勝負。明軍遠道而來，元軍則以逸待勞，故而爭奪極爲激烈。最後，身爲統帥的徐達親臨前線殺敵，明軍士氣大振，纔將元軍擊敗。此次大戰明軍全殲元軍，俘虜元郯王、文齊王及國公閻思考、平章哈扎兒、虎林赤等官佐1865人，普通士卒84500餘人，馬15280匹。其他的駱駝、驢、騾、牛、羊數以萬計。擴廊帖木兒和妻子數人從寧夏黃河中漂浮的木頭上渡河逃走，投奔和林。至此，甘肅境內已無元軍主力，明軍分派各軍攻掠各地。鄧愈克河州（今臨夏市），大批吐蕃部落歸降，明政府依照元代舊制，把歸降的部落首領封分爲土司。第二年，馮勝、傅友德再次西征。馮勝命穎川侯傅友德爲前鋒率五千騎兵，直取涼州，擊敗元將失喇軍，繳獲大批軍用物資。而馮勝則沿河西走廊向西進攻，先後攻佔甘州、肅州、額濟納、瓜州，至此甘肅徹底歸明中央政府管轄。
四、常遇春、李文忠攻開平之戰洪武二年常遇春，李文忠攻開平之戰，一舉拔掉元上都，元順帝倉皇逃竄，一年後病逝，此戰後，明朝修築了開平衛，俯瞰整個北方蒙古草原，之後的幾十年，雖然蒙古人偶有勝仗，但基本都是被明軍追亡逐北。
點評：雖說徐達攻克元大都標誌着元朝的滅亡，但是在蒙古人敗退大草原以後，真正導致明蒙雙方攻守易形的則是開平之戰，開平是元朝的上都，也是蒙古草原重要的戰略要地，奪取了開平，也就意味着卡住了蒙古草原的咽喉，與遊牧民族作戰，一是要作好打持久戰的準備，二是要要建立強大的騎兵隊伍，三則是要搶佔到關鍵的戰略要地，漢武帝反擊匈奴，第一槍就是在河套平原打響，因此纔有了後來匈奴的倉皇西逃，唐朝反擊突厥，首戰也是先取定襄，纔有了重創突厥的奇功，而宋之敗亡也在於幽雲十六州的丟失，使得宋軍痛失戰略要衝地，百年來一直處於強敵的壓迫之下。開平戰役的意義也正在於此，雖然此戰的戰果算不上豐碩，但是戰略意義重大，此戰後，明朝修築了開平衛，作爲繼續進逼蒙古帝國的基地，之後徐達藍玉等人的一連串勝仗，也正是此戰打下的基礎。遺憾的是，自宣德開始，處於削弱藩鎮勢力的目的以及文官統治集團的短視，開平衛最終被廢弛，鬆散的蒙古部落聯盟得以繼續騷擾長城沿線，以至於釀成了土木的慘案和明朝皇帝被俘虜的恥辱，前人攢錢，後人敗光，不知當年病勢於柳河川的常遇春將軍若泉下有知，當做何感想呢。
五、明軍北京保衛戰明正統14年，瓦剌大軍在土木堡將明軍打得全軍覆沒，並俘虜明英宗，名將於謙指揮北京保衛戰，大破也先大軍，迫使其交還英宗。瓦剌軍的兵敗引起了一系列連鎖反應，也先在內訌中被殺，分散的蒙古部落又重新接受了明朝的冊封。
點評：十五世紀中葉是世界歷史上值得記住的一段日子，從1449年到1453年，東西方兩大文明古國——中國與羅馬。他們的首都相繼遭到蠻族的圍困，不同的是：明朝以其充足的國力和出色的指揮打贏了北京保衛戰，而東羅馬則在彈盡糧絕後國破家亡，被土耳其人亡國滅種。土耳其在東羅馬的土地上把奧斯曼帝國推向了極盛，瓦剌人則在北京城下遭受到又一次沉重的打擊。事實上，土耳其滅亡東羅馬是順理成章，而瓦剌軍兵敗北京也是實力使然。在封建時代，如明朝這樣的生產力高度發達的帝國，只要內政統一經濟穩定，是沒有任何國家可以滅亡掉的。宋朝積弱如此，但鼎盛時期的遼國也同樣不能滅之，宋朝和明朝最終的亡國，其實是亡於和國內嚴重尖銳的階級矛盾，而此時的明朝尚未到這一步。雖然此時的明朝正走向，而朱元璋時期建立的衛所制度已經出現的腐化的情況，但是明軍的實力尤存，土木之敗確有士兵戰鬥力下降的緣故，但更重要的還是荒唐的指揮。在明朝朝中，也存在着一批實幹派的大臣，英宗被俘虜後，滿朝哭哭啼啼，還好有于謙爲首的一批明白人堅信明朝必勝。
而另一個需要注意的是，在土木堡五十萬大軍全軍覆沒後，明朝又在短短的時間裡組織了22萬精兵，這種驚人的戰爭動員能力以及物質基礎，都是瓦剌人所無法相比的。于謙並不是一個典型的職業軍人，反而是一個文官，而此戰也並非是考驗他的戰場拼殺能力，而是戰略部署能力和統籌規劃能力，對於此時的明朝來說，只要可以做到君臣一心，三軍用命，此戰的勝算就已超過八成，于謙很好的協調了各方面的矛盾，圓滿的完成了這一切。這一戰明朝打敗了瓦刺人，但是攻守雙方卻調了個，從此以後，明軍更是龜縮於長城堡壘之中，很少再有大兵團出塞作戰的戰例。而實力遭到嚴重削弱的瓦剌人，也沒有再對明朝形成致命的威脅，至多隻是騷擾明朝邊境而已。但是之後于謙對於明朝軍隊所進行的一系列改革，還是使明軍在一段時期裡恢復了強悍的戰鬥力。