遼東在明朝時期指的是遼東都指揮使司，也就是大明九邊重鎮裡的遼東鎮，隸屬於山東宣承布政司，是明朝最大的軍事重鎮，轄區面積只比現在的遼寧略小一點。
軍鎮是明朝獨有的地方行政單位，是爲抵禦元蒙的反攻而設立起來的邊防區域，在軍鎮裡幾乎沒有縣、府、州等行政單位，大部分都是衛所。像遼東鎮就由二十五個衛所和兩個州組成，一個衛所管轄的地區相當於現在的一個縣。
這次兵變發生的地方寧遠衛就是這樣一個小縣城，那麼爲什麼遼東巡撫和遼東總兵都窩在這麼個小縣城裡面呢？皆因自萬曆四十六年（公元1618年）開始，建州女真也就是後金全面進攻遼東鎮，到崇正元年，整個遼東幾乎全部失守，只留下從山海關-寧遠-錦州這一塊狹小的地區作爲最後的堡壘，來抵禦後金的入侵，這就是有名的寧錦防線。
要知道過了山海關那可就是北直隸京師地界了，寧錦防線的重要性可想而知。所以，一聽說寧遠兵變，整個大明朝廷都震驚了，這簡直是自毀長城啊，寧錦防線一失，後金的鐵騎便可長驅直入，一直衝到京城！
孫承宗自然知道寧錦防線的重要性，他匆匆的招來三軍營提督袁可立和兵部左侍郎袁崇煥，然後便領着一千多錦衣衛親軍出發了。
京城到山海關差不多有一千里，王之臣原本以爲朝廷的欽差大臣起碼要走上十天半個月纔會到，卻不曾想碰上了孫承宗這個猛人，只帶了一千親衛一路打馬狂奔，三天就衝到了山海衛駐地！
王之臣正組織一幫親信掩蓋罪證，製造假象呢，這行動剛剛開始就被孫承宗逮了個正着。於是，一個巨大的貪腐集團呈現在孫承宗的面前，饒是他見慣了大風大浪也被這幫人的貪婪給嚇了一跳！
他們不但剋扣糧餉還吃空額、以次充好、走私販賣違禁物品等等等等，總之，凡是能撈錢的，他們都幹，就是不好好整軍備戰！
這畢自肅就是因爲太清廉了，所以被他們排擠在外，本來王之臣是不打算剋扣寧遠衛的糧餉的，因爲寧遠衛總共纔不到五萬人馬，他報上去的卻是十萬，就算糧餉全給他們發了，還有一半的空餉進了他的腰包！奈何這次朝廷對閹黨的清理來的太徹底，他這種依附閹黨爬上來的官員也是清理對象，他不得不耗費錢財上下打點。
這錢財耗費的多了，他就開始心疼了，乾脆一不做二不休，把餉銀全扣下了，光發糧草，反正又沒打仗，一天到晚閒着，能讓你們吃飽已經不錯了！
他想着反正上面有人兜着，應該不會出事，卻沒想到上面是兜住了，下面卻沒兜住，寧遠衛竟然集體鬧事了，畢自肅這貨竟然自殺了！
王之臣本來就是那種善於阿諛奉承的人，他知道被孫承宗逮住了自己是躲不掉了，乾脆老實交代，爭取給個痛快，竹筒倒豆子，把他剋扣糧餉、行賄受賄的事情全交待了。
這下他是痛快了，孫承宗卻不痛快了，東林黨的骨幹竟然被這貨腐蝕了將近一半！這要是捅出去，東林黨豈不是臭名遠揚！
孫承宗此刻面臨着艱難的抉擇，要麼如實上報，那東林黨的清譽就全毀了，要麼隱瞞不報，那他個人的清譽就毀了，也許別人不會知道，但他自己心裡清楚啊！
按他的行事作風，如果不是涉及到東林黨，哪怕是天他都敢捅個窟窿。但一涉及到東林黨他就猶豫了，葉向高、**星、高攀龍、楊鏈、左光斗等等，一個個東林黨領袖的音容笑貌浮現在他的腦海，如果把事情捅出去，這些鐵骨錚錚、清廉無比的東林黨領袖歷史又將怎樣評價？
最後，孫承宗痛苦的選擇了隱瞞不報，他咬牙切齒的對王之臣宣判道：“把你手下涉嫌貪腐的官吏全給我列出來，把拖欠的餉銀全給我補齊了，我饒你不死！”
王之臣簡直不敢相信自己的耳朵，他以爲落在孫承宗手裡絕對是死定了，能爭取個痛快就算不錯了，只要不凌遲處死，他都是可以接受的，卻不曾想自己竟然還有活路！
他並不是那種愚笨之人，腦子裡面略微一轉就明白了其中的關鍵，這孫承宗也是東林黨人啊，而且還是東林黨的領袖，所謂家醜不可外揚，他這是給東林黨遮羞呢！
有了這個認知，他自然是積極配合，凡是參與貪腐的，他一個不拉，全都交待了。拖欠的餉銀問題也不是很大，光他們吃的空餉就是餉銀的兩三倍，花是花掉了一大半，剩下的補齊拖欠的餉銀還是夠了的。
於是，王之臣被罷免薊遼督師兼遼東經略的職位，由袁可立接任，袁崇煥被重新任命爲遼東巡撫。至於寧遠的兵變，有了銀子那還有什麼不好處理的，先把帶頭鬧事的咔嚓咯，再把拖欠的餉銀髮咯，還有誰敢鬧事？又有誰還會無聊的想尋死！
平定了寧遠兵變之後，孫承宗又定下了全遼攻略，總結起來就四條：
第一，練兵，現在整個寧錦防線實際兵力不到十五萬，空額空餉的超過一半，他在當地軍戶中將空額人員招滿，命人日夜操練，隨時做好戰鬥準備。
第二，築城，寧錦防線各衛所駐地全部加固，修成一個個戰鬥堡壘，全部變成難啃的硬骨頭，讓後金的鐵騎無從下嘴。
第三，屯田，鼓勵當地軍戶開荒屯田，由朝廷提供種苗，減輕稅賦，能保證駐軍糧草供應就好，如果不能保證也沒關係，主要是要讓他們種，這些田可都是他們自己的，後金來了，他們能不拼命保護嗎？
第四，招賢納士，建立佔天館、查地館、譯審館、偵諜館、異才館、大力館，招納各種人才，加強軍隊戰鬥力。
在孫承宗的經營下，寧錦防線愈發堅固了，皇太極連派小股部隊騷擾的心情都沒了，一心跑到蒙古草原擴充他的勢力去了。
寧錦防線堅不可摧大明就高枕無憂了嗎？當然不是，寧錦防線跟二戰時的馬奇諾防線有驚人的相似之處，地球是圓的，你只守住一面是沒有用的，皇太極雖然不是希特勒，但繞道這麼簡單的策略，你能指望他永遠想不出來嗎？
當然，朱慈炅也不是朱由檢，繞道這種事情重在出其不意，如果事先就被對手發覺了，到時候誰把誰繞進去就不知道了。