科舉的難點不僅在於對答，同時對於考生的體力也是巨大的考驗。他們需要竟日構思，部分人因精力不濟，答卷後半多潦草。
朱由檢沒有考驗自己，在下面轉了一圈就撤了，不過就這已經算是非常給面子了，大明最近這幾代皇帝都是怠政先鋒。
世宗晚年，每殿試，多命閣臣擬題，帝但署名而已，未嘗親策也。萬曆皇帝僅提前擬定策題，由禮部官員代爲宣讀。像朱由檢這樣親臨現場當庭宣讀試題的，難能可貴。
朱由檢回去睡大覺，傍晚再來的時候，受卷官、掌卷官已經將考卷收齊，統一封存，而後由錦衣衛押送至內閣待閱。考生全部在場，沒有擅自離場或提前交卷的。大明規定“殿試畢，進士出，不得私謁讀卷官，違者論罪。”
考生們將會回到各省的會館享受 VIP至尊服務，等候傳臚。大明的科舉從一開始就有着濃厚的鄉黨氛圍：商人會資助他們看好的考生，建設家鄉會館給考生提供住宿；考生考中之後，也會回饋家鄉，給家鄉爭取有利政策。既然大家都這樣玩，那麼朱由檢也要來一個入鄉隨俗了。
內閣大臣、六部尚書被朱由檢任命爲閱卷官，負責閱卷。其中有沒有貓膩就不清楚了，不過如果有人可以說動帝國最牛逼的這幾個人幫他舞弊的話，那麼區區進士都算委屈此人了。而朱由檢則是開始查戶口，讓太監把這三百五十三人按照地域戶籍分類。
兩天後，殿試答卷批閱完畢，內閣送來二十份進呈卷，讓皇帝圈點調整排序，選出進士及第人選。朱由檢直接拎着這二十份答卷來到了內閣，二十份怎麼夠，他要將二甲一網打盡！
朱由檢的到來讓文淵閣內的衆大臣嚇了一跳。他們改完卷子以後並沒有散去，因爲按照以往的經驗，皇帝有可能會選擇困難，然後召見他們詢問意見。然而他們卻沒有想到，皇帝沒有召見他們，反倒是自己跑過來了。這是對他們的批改結果不滿嗎？他們可是很認真地參考了皇帝的意見啊？！
“陛下，這二十份進呈御覽的卷子，莫不是有甚不妥之處？”畢自嚴起身拱手道。
“放寬心，且請入座，朕不過是一時興起，想瞧瞧爾等批閱的結果，再將其重新排個次序罷了。”朱由檢輕描淡寫地說道。
“那你這不就是覺得我們批改的不公正，打算推倒重來嘛？”衆人心中腹誹不已，面色都變得有些不太好看。他們批改沒有費多大的勁，排序可是經過了好一番博弈，結果皇帝說名單作廢？！那他們辛辛苦苦排個什麼勁啊？“皇帝你又不是進士，就你那文化水平，你看得懂嘛你？！”
讀卷官先將所有試卷分上上（甲）、上下（乙）、中上（丙）、中中（丁）、下上（戊）、下下（己）六等。
朱由檢在前三等評價裡面，再按照地域、戶籍分成類，然後在衆臣詭異的目光之中，像是疊葉子牌一樣從分類裡面抽取，很快就形成了新的排序。
朱燮元喉結滾動，忍不住開口說道：“陛下，此舉是否太過草率，可否再斟酌一二？”
“哪裡草率了？我可都是按照你們批閱的結果排序的啊。對了，這個不對，你們會錯意了，這個算三甲末等吧。”說完，朱由檢從中上等評價的卷子堆裡抽出史可法的卷子，丟到了一旁。
羣臣更是面面相覷，不知道此人怎麼得罪皇帝了，看他的文章雖然空泛了一些，但從文采、經史、書法的角度來說，也是有一定可以稱道之處的，倒也不至於被排到最末啊？！！
最後，朱由檢圈定：狀元爲張羅彥，北直隸河北萬全都司涿州衛人，其家族世代軍戶；
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榜眼爲管紹寧，南直隸常州府武進縣人，出身寒門；
探花爲朱統鉓，是大明落魄宗室，寧藩瑞昌王裔，貫寧藩瑞昌王府宗籍，是寧王朱權的後代。
寧王一脈被王陽明幹了一槍，已經半死不活了。
衆人這下子全明白了，明白過來以後，心中甚至有些膽寒。還好他們的皇帝陛下不是太祖，不然又來個南北榜，他們哪裡受得了？閱卷官第一個死！
如今的內閣大臣裡面：畢自嚴，山東淄博人；朱燮元，浙江紹興人；施鳳來，浙江平湖人；張瑞圖，福建晉江人；李國棤，北直隸真定府人；郭允厚，山東菏澤人，南北各半。朱由檢那是精心設計過的。
進士及第和進士出身的人往往升遷最快，影響一個時代政治格局的，朱由檢怎麼可能會不重視呢？幾位閣老和尚書的利益交換，朱由檢懶得去深究，但真要他裝眼瞎是不可能的，他最多隻能部分承認，然後再攪個局。
除了一甲進士及第外，此次考試還選出了九十七名二甲進士出身，一甲二甲湊了一百人，在歷次科舉考試裡面都算多的。這樣做是因爲大明缺官：前宋飽受冗官的影響，大明被萬曆折騰了一下，矯枉過正，反倒是變得嚴重的缺官。
大明的稅收不上來，中央職權部門辦事效率低下，也跟這種缺官的情況不無關係。按照一甲的神奇分法，朱由檢給二甲進士重新排序，南北地域儘量保持公平，但階級有偏向性。
“沒必要啊，咱們大明沒有世家門閥了呀。”衆臣看着皇帝一頓操作，心中有些無語。
而朱由檢想的卻是，大明雖然沒有傳統意義上的世家門閥，但是有學閥啊，不然那些歷代書香門第、世代官宦怎麼來的，還真以爲窮人家的孩子就笨蛋啊？！他能做的也只是在衆多學二代裡面撈出那麼一兩條真正的卷王、學一代而已。
“朱尚書，朕打算開辦武舉殿試，你們兵部合計一下。”朱由檢冷冷一笑，繼續說道，“武進士參與殿試不合格者，革除進士功名，合格者授予邊關武職，怕死的勿來！”