1856年9月4日凌晨，陳承鎔引韋、秦大軍徑入東王府，斬殺楊秀清及54王娘。
韋昌輝喜曰：“楊逆一死，乾坤已定。待天王詔告天下，我等便可兵戈入庫，酣眠三日。石翼達開，只宜常駐安慶矣！”
陳承鎔道：“吾已密稟，天王即刻昭告天下。”
韋、秦大軍盤踞東王府竟日，不見洪秀全發詔。
是夜，東殿尚書傅學賢、吉文子集軍四千，紮營峨嵋嶺、虎賁倉，遙峙東王府。
韋昌輝道：“天王不語，與傅、吉血戰難免。”
秦日綱道：“天王遲不發詔，是何心思？再遲，天京血流成河矣！”
陳承鎔道：“天王斟酌語詞，或許明日即發。”
韋昌輝嘆道：“園中有樹，其上有蟬，蟬高居悲鳴飲露，不知螳螂在其後；螳螂委身曲俯欲取蟬，不知黃雀於其旁；黃雀全神貫注於螳螂，卻不知人已撒網。兩位兄弟，天網恢恢，欲罩吾身。今夜先斬傅學賢、吉文子，魚死網方破！”
韋昌輝等血戰一夜，斬殺傅學賢全部，韋、秦之軍亦損大半。
秦日綱道：“東殿餘部多如過江之鯽，如此下去，不出兩日，吾皆亡矣！”
韋昌輝道：“無毒不丈夫，天不下詔，吾即矯詔。以秀全名，宣我叛逆，枉殺東王；午時三刻，斬我於市。楊逆昭雪，其下必觀，關門殺之！”
陳承鎔道：“矯詔欺君，天王必怪；事成與否，我等皆無退路矣！”
韋昌輝道：“生死存亡，不敢多顧，我等兄弟齊心，先解燃眉之急。東殿人去府空，吾兄弟刀槍在握，天王亦當三思。”
秦日綱道：“別無旁道，僅此一途！幹！”
天王詔誅北王，天京沸騰，東殿餘部，紛至沓來，皆欲圍觀昌輝死狀。午時三刻，東殿四門忽閉。一聲炮響，矢彈齊放，四千東殿將士，斃於刀槍之下。
陳承鎔放下屠刀，豎立拇指，媚對昌輝，嘖嘖稱奇。
秦日綱道：“東殿餘部萬餘老幼婦孺，該當何置？”
韋昌輝道：“昨死之人，皆其兒孫父子；這萬餘婦孺老幼，恨不得剝吾皮、食吾肉、吸吾髓，一不做二不休，斬草再除根！”
是夜，天京城裡嘶哭震天，韋、秦、陳揮舞刀矛，將八千老幼婦孺，全皆殺死。
石達開聞訊，三騎入城，詰責韋、秦、陳濫殺無辜。
韋昌輝不忿，道：“出爾反爾，乃何居心？鷸蚌相爭，誰人得利？吾儕無能，方致此步！”
石達開詞窮，拂袖而去。
秦日綱道：“石達開兵逾三萬，提軍臨城，我等危矣！”
韋昌輝恍然大悟，後悔不迭，道：“乍見石某，氣貫腦際，這一恍惚，險誤大事。速追石達開，殺之。”
韋、秦、陳兵至翼王府，搜遍犄角旮旯，獨不見石達開。遂將石府一衆老小，全皆殺光。
石達開悲慟萬分，親領兩萬大軍，浩蕩開來；兵停蕪湖，上書天王：舉兵靖難，殺韋、秦、陳三惡，以平民憤。
安徽寧國。朱鳳魁一軍已被鄧紹良圍困半載，聞石達開至，火速求援。達開分兵，攻克涇縣、宣城。又令陳玉成兵出金壇，馳救寧國。
張遂謀道：“楊國宗萬餘大軍，鏖戰徽境，救否？”
石達開道：“非敵非友，任其死生。”
石達開兵至蕪湖，浙江巡撫何桂清急疏：賊軍久思佔據皖南，窺伺江浙。現石賊已下宣、涇二縣，各鄉村賊勢已蔓延百餘里，思與寧郡之賊聯爲一黨。鄧紹良飭令各營伍，以五成扼守營盤，兼顧寧城攻剿，以五成迎擊石逆。鄧部兵不足五千，實屬萬分支拙。
咸豐帝諭令和春分兵援寧。和春以江南攻剿萬緊，分兵一千，應援鄧紹良。
陳玉成領石達開令，率兵八千，馳赴寧國，於團山、七裡岡、夏家渡，一字排開，結營26座。
鄧紹良親赴督戰，先攻團山、夏家渡，引玉成分兵，忽又集全力夜襲七裡岡，玉成猝不及防，棄營而遁。
鄧紹良再無顧慮，半月時間，九攻寧國。
陳玉成整軍二至，於團山、妙葛山紮營10座。鄧紹良不爲所動，僅分少兵牽制，主力繼攻寧國。是夜酋刻，寧國四門火起，朱鳳魁疑細作入城，驚惶不迭，探報東門已破，鳳魁鬥志全無，再無心戰，彙集餘部，突圍而去。
石達開兵臨蕪湖，洪秀全密召秦日綱、陳承鎔，道：“殺東一人，殺其兄弟三人，原清、輔清而已。如此殺戮萬餘己之兄弟姐妹，天堂無二位位矣！”
秦日綱、陳承鎔跪拜，道：“啓稟天王，實乃迫不得已，全皆北王唆使。”
洪秀全道：“朝聞道，夕死足矣！懸崖勒馬，亡羊補牢，爲時不晚。”
秦、陳復跪，皆道：“任憑天王差遣，天王萬歲萬歲萬萬歲。”
秀洪全道：“翼王兵臨蕪湖，二位危矣！”
秦、陳再跪，齊道：“請天王相救！”
洪秀全道：“縛得韋逆昌輝，朕保二兄弟無恙。韋逆昌輝，天京城內，除你二人，別無友朋。日綱兄弟，聽聞爾母壽誕將至；將功贖罪，絕好之機。”
1856年11月1日，秦母壽誕，秦日綱大宴賓客，韋昌輝來賀，被縛。
洪秀全謂昌輝道：“朕本無殺渠意，爾矯詔濫殺，天怒人怨，朕亦無奈耳！兵丁勿算，萬餘老幼婦孺，血漫秦淮，屍橫大江，抵爾一命乎？“
昌輝直目斜睨，挺胸昂首，沖天一呸，道：“事至於此，無爾匹夫事乎？爾匹夫嗜人鮮血、貽誤天國！爾乃最惡之人！畜生不如！復又嘆：金田何其盛，吾產千萬頃；六載空耗命，鼎食大鐘鳴？天兄殺天兄，原來一場空！塵世萬千怨，如夢亦如幻！“
韋昌輝被五馬分屍，肢體切做方寸小塊，暴曬城牆之上，旁有銘文：北奸肉，只可看，不可取。其首匣裝，送至石達開處。達開觀瞻確屬，復又上書秀全：首惡必除，無辜勿殃；秦、陳不死，哀兵不息。
洪秀全無奈，斬殺秦日綱、陳承鎔；含淚誥諭：東王蒙難，千古奇冤。韋逆昌輝，矯詔弒殺，罪該萬死。
翌日，洪秀全再諭：爺遣東王來贖病，眼蒙耳聾口無聲；天曆三重識東王，降託東王是父皇；爺前下凡空中講，爺今聖旨降託楊。謝爺託降贖病主，乃埋世人轉天堂。七月念七東昇節，天國代代莫相忘。
11月下旬，石達開奉詔回京。
洪秀全一見達開，淚眼婆娑，道：“翼兄至，天國有望矣。朕無能，眼見天兄闔家老小被屠，竟無力阻，悲矣愴矣！韋逆部屬、親朋，無論老幼婦孺，朕已圈定，任憑兄治。”
達開嘆道：“舉兵靖難，只懲首惡，不咎部屬、親朋，況老幼婦孺乎！經此鉅變，天國上下，人人自危。天王亟需下詔安撫，收服民意；斂兵收戈，平復民心。各地將士，務必謹守駐地，切勿輕出，以爲妖所乘。向妖已死，江南無慮。天京此變，傷筋動骨，再令陳仕章、塗鎮興、石鎮吉回京護駕，李世賢兵援蕪湖。吾鎮江兵厚、瓜州軍強，句容、溧水，區區小縣，一週勝富足矣。”
洪水秀全道：“前時皖北告急，朕已令李秀成馳援無爲、桐城。經此鉅變，天國已危如壘卵。秀清陰鷙，昌輝暴戾，王兄早至兩月，何有這等干戈！今後，朕之天國，即兄之天堂！”