臨清、湘潭二戰皆敗，楊秀清驚詫，急詔：頂天侯秦日綱擢升燕王，領兵救援廬州，一俟廬州圍解，即統兵北伐，應援林李；胡以晃兵出廬州，攻擊和春、福濟，以爲接應；羅大綱進駐安慶，代秦統軍。林紹璋革職留營、戴罪立功，石鎮侖代統其軍；石祥禎固守嶽州，相機進剿；曾天養飛馳入湘，應援嶽州；韋俊剋期攻取武昌，切勿再延。
秦日綱接令，率兵一萬，北進舒城。和春速遣秦定三率兵攔阻。秦日綱屢攻不進，遂以北路官軍甚多，兵單難往，復退安慶。秦定三趁機攻佔六安，屯三角井。
六安失，楊秀清遷怒胡以晃，褫其王位，調攻江西；再斥秦日綱進退隨意，不思進取；又調夏官又正丞相周勝坤、秋官又副丞相陳宗勝代守廬州；復令羅大綱率兵援北。羅大綱血戰秦定三十八日，無果。
1854年5月28日，石祥禎接楊秀清軍令，即自嶽州西進，首克華容，斬知縣宋昌期。6月8日，連船千艘，乘風過洞庭，搶佔龍陽、滄港、白沙，11日，攻佔常德府城，殺知府景星。
曾天養、陳玉成克得宜昌，返攻荊州。荊州將軍官文、青州參將王國才合兵力拒。兩軍接戰月餘，僵持不下。
曾天養接楊秀清援湘令，遂棄荊州，南下入湘，6月12日，攻佔澧州、安鄉，匯合石祥禎部，前鋒西入桃源、辰州。曾、石督率主力，復逾洞庭，東入嶽州，修城築牆，浚濠並溝，添設外營，以爲負隅久抗之計。
曾天養入湘，楊秀清即令石祥禎回京述職。
國宗韋俊圍攻武昌三月，屢攻不破，韋俊寢食不安，嘆道：“石祥禎、曾天養二將軍飛速猛進，皆爲吾作嫁衣裳。吾屢攻不克，何面目示人？”
左四軍糧官陳玉成道：“圍城曠日，妖如驚弓之鳥，予吾一軍，夜攀城牆，合力一呼，妖即潰散。”
國宗石鳳魁道：“武昌城高，爾可小心。”
韋俊道：”實乃良策，予兵五百，夜襲城垣。”
石鳳魁道：”靖港一戰，吾兄祥禎大勝曾妖；湘潭大敗，吾兄避敵鋒芒，暫退嶽州，卻被召回天京述職，吾兄有何過錯？”
韋俊道：”吾以爲乘勝追擊者多，乘勝退卻者無。左四糧官陳玉成，速挑精卒，夜半奇襲。”
陳玉成領令，率兵偷攀牆垣，趁亂放火，齊聲高呼：天兵來了！天兵來了！
武昌清軍堅守八十三日，精疲力乏，智亂神迷，聞聽此言，軍心大亂，頃刻土崩瓦解。韋俊趁勢奪城。
太平軍二克武昌，楊秀清喜陳玉成之智勇，擢升玉成爲殿右三十檢點，統領後十三軍、水營前四軍。
武昌城破，湖北巡撫青麟逃至長沙，入城便拜。駱秉章、曾國藩趕緊扶慰。
青麟道：“武昌城失，吾無命矣！”
曾國藩道：“勝敗常事，大人勿憂。崇綸何去？”
青麟道：“城破前一日以丁母憂遁去。”
左宗棠道：“殺人放火兒孫旺，修路補橋雙眼瞎。去歲，此廝作祟，致田家鎮兵敗。廝上疏彈劾，張石卿大人北去魯地，荊襄戰事一發不可收。”
青麟道：“張制軍去時，三千兵勇頓足捶胸。可憐吳文鎔公，上任月餘即被逼出徵，崇綸陰阻兵、糧，吳制軍命殞大江。吾本差委湖北學政，恰遇匪亂，死守德安。遂擢鄂撫，賊逆圍城，崇綸暗中掣肘，臺涌一兵不發，吾苦撐三月，彈盡糧絕，城破身死，自是好局。今日至湘，只報諸大人鄂域人事。”
曾國藩道：“墨卿兄放心，吾即集精兵，討伐長毛賊逆，武昌光復之日，即爲崇綸死期。今有一事相求，萬望中丞大人應允。”
青麟道：“已然身死，萬死不辭。”
曾國藩道：“吾用三百精兵，以中丞大人作餌，誑入武昌府，以作內應，如何？”
青麟道：“武昌一失，即爲亡人，有何不可！”
武昌二失，咸豐帝怒諭：湖北巡撫青麟，城破逃遁，罪不容赦！俟其到荊州時，交荊州將軍官文傳旨正法；湖廣總督臺涌萎葸株守，即行革任；着直隸布政使楊霈接任湖北巡撫兼署湖廣總督。
恭親王奕忻道：“今有英、法、美三夷國特使，進至天津，稟奏修約，曰全境開放，曰鴉片買賣合法，曰廢除內地子口稅，曰夷人進駐北京。青麟可否南下粵地，與夷交涉一二，或可轉圜。”
咸豐帝道：“何止英、法、美，俄夷亦已入侵朕之黑龍江。與俄夷，應以尼布楚之約扼制之。與英、法、美三夷，仍當堅持定約。既不必激其另生枝節，也不準遷就了事，更不能示之以弱，露有羈縻之形。總宜不亢不卑。朕已諭令葉名琛，斷不容以十二年變通之說，妄有覬覦。接見夷官等儀文，仍當恪守舊章。不得以夷官等有相待稍優之請，少涉遷就，以致馳其畏憚之心。葉臣久任粵疆，熟悉夷情，必能設法駕馭，操縱得宜。修約之事，江蘇撫臣吉爾杭阿奏稱略爲變通，該撫聯夷剿滅小刀會匪，氣勢甚旺，信口言說，朕必杜其妄念。”
奕忻道：“夷務事繁，亟缺人手。念青麟苦苦撐持八十餘日，城破方走，可令其南下撫夷，戴罪立功。”
咸豐帝道：“青麟護守德安，念其勤勞，委以重任。省垣佈置，屢次擊賊獲勝。八十餘日之中，困苦艱難，所奏原無虛假，朕方嚴催援兵接應。六月初間，魁玉、楊昌泗等連破賊營，但能激勵力戰，何致遽陷？嬰城固守，解圍有日，猶將宥過論功。縱力盡捐軀，褒忠有典，豈不心跡光明？乃倉皇遠避，徑赴長沙，直是棄城而逃。長沙非所轄之地，越境偷生，何詞以解？若再加寬典，是疆臣守土之責，幾成具文，何以對死事諸臣耶！朕賞罰一秉大公，豈能以前此微勞，稍從末減？ ”
翌日，咸豐帝復諭兩廣總督葉名琛：覽卿所奏各夷情狀，實屬明晰，亦能善體朕意，示以鎮靜，不但杜其無厭之求，並免另生不測，以致擾亂大局。卿其永勵斯志，忍待軍務悉平，彼時餉裕氣復，斷不任其狡獪嘗試，時存窺測。朕雖未與卿謀面，第往返批答，不啻千里論心。
不日，咸豐帝又諭曾國藩：兵、船如成，適時東征，光復武昌，西南半壁，賴臣一人。再諭向榮：粵水師紅單船即至，朕倒看爾如何攻奪鎮江、金陵！
兩廣總督葉名琛接旨，謂廣東巡撫柏貴道：“聖意殷切，必不辜負。”
柏貴道：“廣州知府來稟，英夷以最惠國之待遇，引望廈條約之三十四款，先稟吾處，又至上海、天津，再至吾處，再言一十二年修約期至，是否敷衍一二？”
葉名琛道：“抑夷之道，不戰不和不晤，耗其耐心，悻悻無趣，必自去之。”
柏貴道：“歷來辦理夷務諸臣，但知有萬年和約之名，而未見其文，更遑論虎門、望廈、黃埔之約，以致誤將通商章程作萬年和約。”
葉名琛道：“約之銘文，字字誅心；國恨家仇，多閱無益。”
廣州將軍穆克德訥道：“倘夷兵叩城，該當何置？”
葉名琛道：“吾皇明諭，示以鎮靜，以免另生不測，擾亂大局。”
柏貴嘆：“即戰，亦無勝算，吾之陸勇，多調湘贛；吾水師之紅單船，盡赴江南。”