???十天以後, 鄭芝龍被召回北京，向多爾袞當面解釋，海軍基地失守，大沽口炮臺被毀的經過情況, 以及他的罪行。《》
雖然說清廷的軍事重點一直是在陸軍方面，但在兩年之前, 遭受最慘痛的教訓卻是從海上打過來的，因此清廷對這支海軍也確實寄於了厚望，同時也不惜花耗了巨資，修建了大沽口炮臺，以保衛北京的安全。這兩年來，清廷花費在大沽口炮臺和海軍身上的白銀己經超過了二百萬兩，也實在是不算少了。
儘管多尓袞也沒有指望讓水軍去進攻中華軍的登州、浙江沿海地區，但至少也要能夠自保吧，那知費盡二年心血，消耗了巨資才建立的水軍，修築的炮臺在中華軍的水師面前，居然還是不堪一擊，而且在一夜之間，全部都毀於一旦，這樣的結果當然讓多爾袞難以接受。
清廷的其他大臣也同樣對這一戰的結果非常不滿，而矛頭也直接指向了鄭芝龍，由其是聽說，在中華軍進攻炮臺的時候，鄭芝龍在水軍基地中按兵不動，任憑中華軍進攻炮臺，也成爲衆人攻擊鄭芝龍的最大口實。
因此鄭芝龍一回到北京，還沒等回家，就立刻被多爾袞招進皇宮，面對他和十幾位滿漢重臣的質問。
其實鄭芝龍在回京的路上早就預料到有這一出，己經想好了應對的話，因此面對盛怒的多爾袞，還有其他的大臣的質問，絲毫也不驚慌，而是鎮定自若，道：“回稟攝政王，此次海軍敗陣，非戰之過，仍是中華軍的艦隊數量衆多，船堅炮利，艦大炮重，我軍實在萬難抵抗，故此纔有此敗。”
多爾袞沒有開口，左側的何會洛“哼”了一聲，道：“鄭提督，水師建立兩年有餘，耗資百萬，打造大小艦船亦有一百餘艘，又購買了紅夷毛戰船，這次中華軍來攻，所用戰船也不過百餘艘，雙方勢均力敵，而你有基地可以存身，又有大沽口炮臺相助，完全可以擊敗中華軍，以報朝廷眷隆之恩。但卻還一敗塗地，不僅基地失陷，還累及大沽口炮臺全軍覆沒，我看分明是你故意殆慢軍機。”
鄭芝龍道：“何大人，海軍不比陸軍，非一二年可見成效，而且下官早曾有言，水戰無他，唯大船勝小船，大炮贏小炮耳。敵我雙方的戰船數量雖大致不差，但我大清的戰船不過都是二三百料的小船，四百料以上的戰船不足十艘，所有艦炮相加，也不過二百餘訂，根本就不堪大用，只有所購的紅夷毛戰船，每艘千料有餘，可載艦炮五六十圢，到是可堪一戰，只可惜只有四艘，孤掌難鳴。而中華軍的戰船，大半都在千料以上，就是二千料以上者，亦不下十數只，各艦所載火炮少則四五十門，多則近百門，如此大小懸殊，強弱分明，自是萬難抵抗。”
頓了一頓，鄭芝龍又道：“早先朝鮮使臣進獻龜甲船，下官曾力言此船虛有其表，並無大用，不可輕造，此言各位大人，還有攝政王想必都沒有忘記吧。然而諸公皆被朝鮮使用盅惑，不聽下官之言，傾盡巨資，造龜甲船二十餘艘，而一戰盡沒，當初若是將巨資全造紅夷毛戰船，縱使只得十艘，這一戰也斷不會如此。如今下官之言勻己效驗，諸公當知下官當日所言無虛。”
鄭芝龍說完之後，滿殿肅靜，這些話鄭芝龍在以前確實都說過，因此一時也都無法再指責鄭芝龍。
過了好一會兒，譚泰才道：“鄭提督，但中華軍進攻大沽口炮臺，你未率戰船出戰，坐觀成敗，中華軍攻入水寨，你也未做抵抗，反而棄寨而逃，這些點歸都是事實吧，你又作何解釋呢？”
鄭芝龍道：“譚大人所說的，確實都是事實，但敵我雙方實力懸殊，剛纔下官己經說過，在當時的情況下，中華軍以鉅艦數十艘，火炮數千門，強攻炮臺。同時也留下了大批戰船，防備我水軍出擊，何況我大清水軍只有這區區百餘艘小船，就算出擊迎戰也是無濟於事，因此下官也不敢輕舉妄動，只能固守水寨。至於後來中華軍來攻水寨，想那大沽炮臺有堅城可守，火炮二百餘門，紅衣大炮不下百門，尚且難以守住。而水寨己無炮臺掩護，更是難以支撐，因此下官才下令放棄水寨，撤入海河內，如此才保全了近五十艘戰船。假如當時強行出戰，必會落得全軍覆沒之局。下官並非怯戰，實在是爲了保全水軍根本，還請懾政王明察。”
多爾袞沉默了半響之後，才道：“鄭芝龍，你先暫且回家，聽候處置。”
鄭芝龍心裡也清楚，多爾袞沒有當廷降罪自己，實際也就等於是自己逃過了這一劫，雖然說降職罷官是不可僻免，但身家性命卻是可以保住了。
現在鄭芝龍也看開了，反正這個水師提督，當不當其實也都是那麼一回事，不當反而更好一些。因此向多爾袞叩謝之後，這纔出宮回到自己在北京的家裡。
當時隨鄭芝龍一起降清的，還有鄭芝龍後娶的幾名妻妾，從及其他幾個兒子鄭世恩、鄭世蔭、鄭世默等人，全家老少共有十餘口人，剛降清時，清廷還打算利用鄭芝龍，誘降鄭成功，因此對鄭芝龍也頗爲優待，封他爲一等精騎呢哈番，相當於候爵，並將鄭氏一門都編入漢軍正紅旗。而鄭芝龍也就在北京安下家來。
不過清廷對鄭氏一門同樣也十分防備，雖然這兩年裡，鄭芝龍出任水師提督，但家眷人等全部都留在北京，不許隨行上任，實際是被清廷當作人質。而鄭芝龍也深知自己一家被清廷所忌，平時也極力約束家人，低調行事，不可肆意妄爲。在北京暴動發生的時候，鄭家都沒有參與。而在動亂之後，八旗貴族大排漢人，但因爲鄭氏一門這時已被編入了漢軍正紅旗，因此沒有受到多大的波及，到是躲過了這一場風波。
等鄭芝龍回到家裡之後，幾個兒子也都趕忙圍上來問候，父子相聚，在密室中坐下之後，鄭芝龍這纔將大沽口這一戰的經過，以及自己被多爾袞放回家中，聽候處置的事情，向幾個兒子說了一遍。
幾人聽了之後，也有喜有悲，年齡最小的鄭世默臉上露出了擔憂的神色來，道：“父親，大哥現在依附商毅，和大清作對，而且這一次在大沽口又殺敗了大清這麼多兵馬，大清會不會因此而怒遷我鄭家，從而對我們不利呢？”
鄭芝龍道：“你懂什麼？你大哥越是這樣，我鄭家也就越是穩如泰山，因爲清廷顧忌你大哥在外，也就不敢輕易對我鄭家動手了。”
鄭世蔭道：“父親，話雖是這麼說，但我們全家老小畢竟都在北京，大哥這樣一味和清廷爲敵作對，終究不是好事，您曾經幾次寫信，勸大哥歸順清廷，但大哥都置若罔聞，萬一清廷羞惱成怒，難說不會對我們鄭家作出什麼事情來。”
鄭芝龍點了點頭，嘆了一口氣道：“世蔭，你心裡在想什麼，爲父都明白，其實你大哥這樣的做法，正合爲父的心意，如果他真的歸降了清廷，我鄭家才永無翻身之日了。”
聽了鄭芝龍的這番之後，幾個兒孑也都大吃了一驚，鄭世蔭道：“父親爲何這樣說？”
鄭芝龍苦笑了一聲，道：“你們的年級也都不小了，有些事情也該讓你們知道，但今天我對你們所說的話，你們只能埋藏在心裡，但絕不可對其他人講，否則我鄭家會立刻遭遇滅門之禍。”
幾個兒子見他說得鄭重其事，臉色也都不禁肅敬起來，鄭芝龍這才道：“當初是爲父一念之差，未聽你大哥、叔父等人的勸告，執意降清。那知滿人本系蠻夷之輩，素無信義，結果自投羅網，被滿清迫脅我鄭氏一門北上，現在全家都被軟禁在北京，形如刀俎魚肉，只能任人宰割。幸好你大哥當日未聽爲父之言，才能逃脫在外，使我鄭氏一門不致全盤皆沒。雖然這兩年以來，爲父曾幾次寫信給你大哥，勸他歸降清廷，但這些都是迫無奈之舉，好在他見識卓著，未從爲父信中所言，後來還能夠重振兵馬，現在依附商毅，與清廷爲敵，爲父心裡，甚是欣憵。只要有你們大哥在外一日，我們鄭氏一家也就還有一線脫險之望。如果你大哥真得如信所言，歸附清廷，則我鄭家從此，全部都受制於人，生死皆不由自己了。”
幾個兒子聽了，也都默然不語，過了好一會兒，鄭世蔭才道：“父親，如果清廷真的因爲大哥，而遷怒於我們鄭家，那又怎麼辦？”
一直沒有說話的鄭世恩這時才道：“如果真的有那麼一天，那麼我們也就只好認命了，坦然受死，終有一日，大哥會殺光滿清諸人，爲我鄭氏一門報仇。”
鄭芝龍的臉也露出了一絲苦澀的笑容，因爲以後的事情，他確實無法預料。