商毅的預料確實沒有錯，淸軍也確實在想辦法解決自己遇到的困難。阿巴泰也知道亂髮脾氣，於事無補，因此也連續幾天都招集衆將，商議目前的對策。
阿巴泰當然不可能懂什麼叫游擊戰術，也不知道自己面對的，其實是一個比以前任何局面都要困難的問題。但身爲一個久經戰陣的宿將，阿巴泰還是十分敏銳的發現了問題的核心所在，那就是商家軍的主力人馬仍然還在。
身經百戰的阿巴泰十分淸楚，去圍剿在青州府、濟南府的零散商家軍，絕對是費力不討好的事情，因爲青州府、濟南府加上萊州府和東昌府的一些地方，也有數千裡之廣，而且山地居多，對手又是土生土長的本地人，對地理環境肯定要比自己熟悉得多。因此就算把自己累死，估計也剿不了多少商家軍。而分散人馬，駐守各地，更是自找死路，這隻會造成自己的兵力分散，讓對手有逐個擊破的機會。因此也怪不得商家軍明明還能守住青州，卻偏偏就主動放棄了。原來是打的這個主意。
不過商家軍之所以能夠這麼做，也就是因爲他們的主力還沒有被消滅，還有萊州和登州也都在商家軍手裡，因此只要是徹底擊敗了商家軍的主力人馬，攻佔了萊州和登州，那麼在各地鬧事的商家軍也就自然可以平定下來了。於是阿巴泰也決定，不管其他地方的商家軍怎麼鬧，而應該立刻集中兵力，先攻下萊州再說。阿巴泰不相信，商家軍連萊州也敢輕易的放棄。
其他衆將聽了，也都認爲阿巴泰的計策很有道理，而且這也是目前唯一的可行之計了，因此也都贊同了阿巴泰的辦法，於是淸軍也就都開始調兵遣將，準備出兵。
現在阿巴泰部下的清軍大約還有四萬五千多人，大部份都駐守在青州，小部份分散駐守山東的其他地方，而方大猷部下還有當地兵力約二千人，都駐守在濟南。這一次進攻萊州府，阿巴泰決定聚集三萬五千左右的人馬，依然派博和託帶五千人馬守衛臨朐縣，防備穆陵關的商家軍，其餘的兵力只重點駐守青州，其他的州縣暫時不考慮。
雖然和剛出兵山東時相比，清軍的總兵力減少了有四分之一強，但損失的基本都是降軍和跟役，而全軍的精銳滿漢八旗兵的損失並不算大，合計起來還有近兩萬人，因此清軍的實際戰鬥力至少還有原來的八成以上。而且清軍雖然損失了十幾門火炮，但最厲害的紅夷大炮只損失了兩門，還剩於三十二門，火銃兵還有五千多人，這也是阿巴泰最大的底氣。
通過這一段時間的情報收集，阿巴泰也大致瞭解到，商毅這時己經調離了山東，出任浙江巡撫，商家軍在山東地區的留守兵力大約在一萬五千到一萬八千左右，其中穆陵關大約有五千兵力，而青州一戰商家軍也損失了相當的兵力，阿巴泰估計應該在三到四千，因此在萊州駐守的商家軍最多隻有七八千人。從人數對比上看，清軍還是佔着絕對的優勢。還是有較大把握的。
因爲淸軍畢竟是外來戶, 對山東甴其是商家軍的控制區域內的情報收集十分有限, 並 不知道商家軍在登州一直在訓織新兵, 更不知道商毅己經率領援軍從水路趕到了山東, 否則阿巴泰絕不敢主動進攻萊州。
而這時滿清的山東巡撫方大猷也親自押送着一批糧草物資，送到了青州。得知阿巴泰要率軍進攻萊州，方大猷也主動請令，願隨阿巴泰一起出戰，隨軍聽用，策劃諮咎。並且還說了一大段什麼食君之祿，必辦忠君之事，效忠大清，鞠躬盡瘁，死而後已之類的話。
阿巴泰想了一想，也覺得有這麼一個人跟着也好，畢竟方大猷是漢人，而且在山東的時間也比較長了，對這裡的情況也熟悉一些，有什麼事情也好問一問，何況方大猷也是一片好心，上陣打仗可是玩命的事情，他一個文官肯隨軍出戰，也很難得，因此也就答應了下來。
而方大猷則是千恩萬謝。阿巴泰當想不知道方大猷的心思，原來方大猷在濟南經歷了一場虛驚之後，但卻是越想越怕，現在己經有三個知縣送了命，只不定那一天商家軍就會拿自己這個山東巡撫開刀。但要他棄官不做，一來方大猷還捨不得山東巡撫這個位置，二來方大猷的家小還在北京，因此這也是萬萬不可。
結果方大猷冥思苦想，終於想出了一個主意來，藉着押送物資的機會，來到了青州。他的如意算盤是青州有阿巴泰親自坐鎮，清軍重兵守衛，應該是安全的，因此到了青州之後，想什麼辦法也要賴着不走。那知一到青州才知道阿巴泰準備去進改萊州，而且還要抽調青州大部份的兵力。方大猷急中生智，立刻主動要求隨軍出征，反正他是想好了，一定要跟着阿巴泰，在清軍的保護下才能保證自己的安全。
阿巴泰不知就裡，還以爲方大猷是一片好心。滿清人打仗到是一把好手，但論耍起心眼來，拍馬也趕不上漢人。要不是當初皇太極收降重任了一批漢族官員，由其是明朝的降官，滿清也不會輕易就奪取了中國。
――――――――分割線―――――――――分割線――――――――
清軍出兵進攻萊州的消息很快就傳到了濰縣，商毅也立刻招集衆將招開軍事會議，研究應對淸軍進攻的辦法。
其實商毅率領着人馬到達山東之後，以商家軍目前的兵力，完全可以和清軍正面大戰一場，但商毅並不打算這麼做，因爲自己和帶來的人馬是不可能長期留駐在山東，總還是要回到浙江去的。山東戰區的事情，還是要讓周少桓他們這些山東的商家軍成員和軍隊自己來解決。因此這一次自己和援軍將只付責當他們的後盾力量和指導，不到萬不得己的時候，不會參與戰鬥。
但令商毅有些沒有想到的是，他在軍事會議上提出了這個想法之後，卻得到了山東的將領們的一致支持，周少桓當即就表示，浙江的援軍只管站腳助威就是了，這一戰就看山東的部隊就行了。
原來在放棄了青州之後，山東的商家軍將士們心裡多少也都有些不服，人人都憋足了一口氣，想要把這個面子給找回來。雖然這一段時間的游擊戰取得了不錯的效果，但毎一次襲擊消滅的清軍人數太少，有時只有二三十人，對商家軍來說，顯然是不夠過癮，大多數人都希望和清軍痛痛快快打一場會戰，或者是殲滅戰，取得一場酣暢淋漓的勝利。因此商毅提出這一戰主要還是甴山東商家軍來打，立刻得到了他們的贊同。
這也說明，雖然商家軍放棄了青州，但軍心和士氣並沒有受到什麼影響，這也是一支成熟軍隊應該擁有的基本素質。也是商毅一直希望達到的目標。
不過衆將士的士氣高漲雖然是好事，但也容易讓人頭腦發熱，陷入不顧一切的蠻幹，而且在商毅的援軍不參與戰鬥的情況下，山東的商家軍和清軍相比，在實力上還是處於絕對的劣勢，如果可清軍硬拼，大打陣地戰，顯然是又走回到了老路上。因此還是要堅持遊擊作戰。但這一次是清軍主動進攻過來，因此雙方正面交戰也是不可避免的，那麼商毅也打算借這個機會，讓商家軍的游擊戰升級，成爲游擊戰和正規戰相結合的作戰方式。
商毅在會議上提出了這個概念之後，又引起了衆將的一陣驚異，不過這次沒有人再懷疑商毅的想法，只是搞不懂他到底是那裡來的這麼多稀奇古怪的想法，同時也等着商毅的進一步說明。
當然商毅也沒有讓他們久等，馬上解釋道：“游擊戰是以襲擊爲主要手段，以出沒無常的攻擊和襲擾敵人，達到殲滅或消耗敵人的目的。靈活、主動、快速、決勝都是它的優點，但游擊戰也有自身的缺點，它始終是一種非正規的作戰方式，因爲游去戰投入的兵力少，而火力弱，很難獨立地進行長時間作戰，僅靠游擊戰，通常不能決定一場大戰役的勝負，因此游擊戰的任務是輔助正規戰、或者是把自身發展成爲正規戰，才能夠奪取戰爭的最後勝利。也就是我剛纔所說的，把游擊戰和正規戰相結合的作戰方式。”
聽了商毅的話之後，衆將這才都有些明白，畢竟現在他們對游擊戰都有了一定程度的瞭解了。
而商毅又進一步解釋道：“拿剛剛結束的青州戰爭來說吧，如果當時在清軍攻打青州城的時候，有幾支遊擊小隊，人數也不用多，數百人就可以了，在清軍的背後搗亂，襲擊清軍的後勤隊伍和小隊人馬，在濟南府、東昌府製造混亂局面，那麼在當時清軍還能夠全心全意的攻打青州城嗎？”
這一個例子也讓不少人都明白了，由其是周少桓幾乎是立列豁然開朗，道：“軍門，我明白了，您意思就是一面在正面戰場和清軍對持，一面派游擊隊在清軍後面搗亂，讓清軍首尾難顧，疲於奔命，然後再給他們最後一擊。”
商毅點了點頭，道：“少桓，你致少說對了七八分意思，但你要明白，正面戰場，不一定就是一定要守在城裡和清軍對持，同樣也可以主動出擊。”