七月底，楊渥正式宣佈實行軍政分離，並且發佈一系列人事調整。
其中，處於淮南內部的升州，常州，潤州，和州，滁州，廬州等八個州全部改爲文官擔任，其中升州刺史爲陳彥謙，潤州刺史王令謀，這兩人都是以前在地方上擔任長史的，而其他六個刺史則是從節度使府的屬官裡面選拔的，比如淮南巡官沈顏，主簿盧樞等，都是在節度使府做過多年文職的官吏，才能不錯，又有一定威望，這纔得到提拔。
歙州刺史陶雅升爲淮北巡撫，負責監管光州，壽州，濠州三州軍政民政；廬州刺史劉威轉爲漣水巡撫，負責泗州，楚州，海州等地的軍政民政。
而其他幾個邊境州的刺史雖然還是以武將擔任，但都做了一些調整。只有滁州刺史劉金沒有調動。
倒不是說楊渥不想動他，而是他父親考慮到劉金如今身染重病，隨時可能病死，在這個時候他不想節外生枝，所以暫時不動。
而楊渥考慮到光州極有可能出亂子的情況，也想盡量先穩住濠州，所以就同意了。
至於光州，光州地方勢力太強，刺史柴再用根本沒法掌控，不過這一次楊渥下定決心要改變這種情況，所以直接將柴再用轉爲統兵將領，刺史之位改由原本的常州刺史李遇擔任，同時調兵五千人隨同他去上任。
這樣一來，雖然在邊境地區的刺史依舊是武將擔任的，但許多刺史都調離了經營多年的地方，前往新的地方上任。這樣一來，至少在短期內不用擔心他們的勢力太大。
而且，剩下來繼續擔任刺史的武將，也都是一些在治理地方上做的較好的，比如李遇，這些人實際上已經完全轉爲文官了，只是他們的武將出身使得他們比那些真正的文官更懂軍事，在邊境地區擔任刺史是個很好的選擇。
楊渥覺得，這麼一批既懂得軍事，又懂得治理地方的人，實在是擔任邊境刺史的最好人選。將來隨着淮南地盤的擴大，這些人或許就是擔任巡撫的最佳選擇。
除了對刺史的調整外，楊渥同時還宣佈了對各軍統兵將領的人選安排。
按照前往各地選拔士兵的工作基本完成，共計有十萬士兵通過了選拔標準，可以進去新的禁軍中，考慮到唐朝如今還在，所以禁軍的名字自然不能用，只好按照原來的稱呼還是分爲牙外軍和外鎮兵。
當然，楊行密的親軍本來就是從軍中選拔的精銳士兵，加上人數較少，這一次沒有進行篩選。而王茂章和李神福二人的部下還在戰爭之中，暫時也沒有進行選拔。楊渥估計，等這兩部進行選拔後，最終能通過的應該與他預料的差不多，在十二萬人左右，可以組成六個軍。
至於六個軍的都督人選也公佈了，其中李承嗣，李神福和臺濛，楊渥這四個人大家都沒什麼意見，唯獨對周本和王茂章二人的任命讓人有些質疑。
周本乃是原宣州刺史趙煌的部將，楊行密第一次被孫儒趕出揚州退守廬州時，在袁襲的建議下攻破宣州，周本就是在那個時候加入楊行密帳下的，資歷並不算高，至於功勞，除了去年攻破蘇州外，也沒有什麼重要功勞。
而王茂章雖然很早就在楊行密帳下擔任侍衛，但他的情況有些類似楊渥的侍衛刁彥能，雖然是楊行密的親信，不過當初打下淮南時，王茂章年齡還小，所以沒有什麼功勞，只是因爲楊行密見他作戰勇敢，這才極力提拔的。
相比於這兩人，許多人覺得像老將張訓，王綰，劉信等才更有資格擔任都督，結果這幾人卻都只擔任了副都督兼師都指揮使。
不過考慮到周本與楊渥的關係，以及王茂章與楊行密的關係，再加上這兩人也的確有真本事，又長期留在廣陵擔任牙外軍將領，比起長期鎮守在外的張訓等人自然更適合一些，畢竟新軍將來肯定還是會分爲駐守廣陵的和鎮守地方的兩種。
所以這點質疑僅僅過了兩天就沒有了，唯一讓人們爭議不休的是各師都指揮使的人選。
六個軍十二個師，就有十二個都指揮使，其中張訓，王綰，劉信就佔了三個，秦裴和朱思勍又佔了兩個，剩下的七人分別是原湖州刺史李簡，原舒州刺史劉存，臺濛的部下米志誠，李神福的部將呂師造，黑雲都的指揮使呂師周，原光州刺史柴再用，以及王茂章的部將朱虔佑。
說起來，淮南的都指揮使有很多，最終當選的卻只有這麼幾個人，大家不服的自然很多。
不過楊渥卻拿出了強硬手段，將那些不服都一力壓制了下去，加上還在廬州的楊行密大力支持，最終這個安排還是被接受了。
在都指揮使之外，楊渥又設立了副都指揮使，算是對部分有資歷，有功勞，又有能力，但沒能成爲擔任都指揮使的人一個安排，比如黑雲都的另一個指揮使李厚，王茂章的另一個重要部將張崇等，再加上對這些將領在別的地方進行了補償，比如加封一些類似檢校工部侍郎的榮譽職銜，算是安撫住了他們。
至於剩下的一大批人則被安排進了新成立的統兵司和樞密院任職。
這其中，統兵司負責軍隊日常的訓練管理，戰時負責後勤供應，這一職務由暫時閒下來的高勖掌管。
高勖以前做過淮南的掌書記，對於這些事物非常熟悉，所以讓他來擔任這個職位比較合適。
而負責軍令的樞密使則由楊渥親自擔任，而他的副手樞密副使則由朱瑾擔任。
雖然同樣是外來將領，但朱瑾曾經作爲泰寧軍節度使，與朱全忠爭鋒了十年之久，這樣一位猛人楊渥自然不敢相信他，軍隊是半個也不敢給他的，不過讓他在樞密院當個參謀出出主意卻是無妨。
除了朱瑾外，嚴可求也被授予樞密副使的職位。
嚴可求雖然是文士，但他在軍事上也頗有謀略，再加上楊渥以後肯定有親自率軍出征的情況，不留個人制衡朱瑾他怎麼放心。