雖然商毅和黃宗義雖然沒有取得共識，但商毅仍然對黃宗羲十分禮敬，請黃宗羲在杭州盤桓幾天，並讓王夫之帶着他在杭州參觀。
黃宗羲本是紹興餘姚人，對杭州也不陌生，在這裡也有不少好友，因此也想逗留幾天。而且他對王夫之的文章頗爲讚許，而且在許多學術觀點上，兩人都有相似之處，也想借這個機會，和王夫之多交流一下，而王夫之也正有此意，自然也十分高興的接手這個差事。
這當然也是商毅有意這樣安排，因爲在另一時空裡，明末清初的三大宗師雖然在學術和思想上都有非凡的成就，但在互相之間基本沒有什麼交集，缺少類似與朱熹和陸九淵、陸九齡，朱熹和陳亮之間的那種交流和溝通，甚致是爭論。現在黃宗羲和王夫之陰錯陽差的見了面，商毅也希望看一看，他們在一起時能碰撞出什麼火花來。雖然兩人都還沒有達到自己思想大成的境界, 但從另一方面來說，卻可以更好的取長補短，吸收對方的長處。致少商毅感覺得到，王夫之的思想觀念，和另一時空相比，己經有了一些新的東西。
於是從次曰開始，王夫之就領着黃宗羲一面在杭州城裡遊覽參觀，一面也交流了許多自己目前形成的觀點看法，雖然也發生了一些爭執，但互相之間都覺得受益非淺，都大有相見恨晚之感，其實如果排除政治立場之外，黃宗羲還是一個相當見識和氣度的人，否則也不可能成爲一代學術宗師。
當然在杭州城裡遊覽參觀的地方也是經過了商毅的安排，主要是目前商家軍在杭州開設的工廠、學校等地，參觀這些地方的時候，自然也免不了談到商毅，王夫之也趁機把商毅在浙江的所做所爲向黃宗羲都介紹了一番，也使黃宗羲對商毅有了一個全面的認識。
商毅在浙江大張旗鼓的搞清理土地，徵收商業稅，設立海關，實際上都是得罪豪門大族的事情，這些豪門大族在浙江當然惹不起商毅，只好紛紛到南京去託人情找門路，希望把商毅給整下去，而南京朝廷現在一來是自顧不暇，二來也確實是拿商毅沒有辦法，無論是馬士英還是吳甡，都不會對也不敢對商毅動手，因此也只能不了了之。
但黃宗羲到還是能夠從中聽到一些關於商毅的風聲，不過多半都不是好事，豪門大族當然不會說商毅清理土地，徵收商業稅，設立海關這些事情做的不對，而是另找藉口，什麼危害地方、貪髒賣法、不尊朝廷、飛揚拔扈之類，反正就是亂扣大帽子。而黃宗羲來到杭州之後，也有不少朋友來找黃宗羲申訴商毅的罪行，因爲黃宗羲的官職雖然不高，但是東林的得力干將，很有影響力，因此也希望通過他向南京朝廷施壓，來管管商毅。
不過黃宗羲畢竟不是那種聽風就是雨的人，至少在目地的政治立場上，商毅還算是偏向於東林一方，而且這幾天在杭州城裡的見聞，還有聽王夫之的介紹解說，也澄清了不少關於商毅的錯誤言論。
其實對清理土地，黃宗羲還是相當贊成的，因爲黃宗羲熟知史料，知道土地兼併對國家財政、對社會生產的巨大破壞作用，而且清理土地也都是得罪人的事情，沒有相當的勇氣和責任感，一般人都輕易不敢去做。整個大明朝也只有兩個人敢在土地上下手，一個是張居正，一個是海瑞。
而徵收商業稅，設立海關這些工作，經過王夫之的解說之後，黃宗羲也明白，其實這是扶植工業商的做法，並非什麼與商爭利。因爲黃宗羲是持工商皆本的思想，傳統的重農抑商觀念。由其是商毅的那一套扶植產業型商人，限制流通型商人的理論，卻是黃宗羲從沒聽說過去，雖然黃宗羲對促進社會分工，瓦解小農經濟、社會化生產這些新詞還有些半懂不懂，但也承認，商毅的這種做法，還是相當有道理的。
還有在玻璃廠、印刷廠參觀之後，黃宗義也覺得自己大開眼界，雖然他不像宋應星那樣重視技術，但也不會對這些技術不屑一顧。畢竟這些技術對國家、對朝廷來說還是相當有用的。
因此黃宗羲也對商毅的印像大爲改觀，因爲原來黃宗羲只當商毅是一個普通的武將，最多也就是第二個戚繼光，但現在才發現，商毅的行爲做法，其實遠遠超出了一個武將的範圍，他不僅有很強的治理地方的能力，而且重視工商業，重視工匠技術，甚致還十分重視教育，可以說就是許多朝廷大臣，也未必能做到這些。由其是商毅制定的浙江學校建設規劃，更是令黃宗羲沒有想到，這確實是一件利在後世百代的好事，但卻是甴一個武將來完成後，也令黃宗羲心裡總覺得怪怪的。
在第三天，王夫之又帶着黃宗羲出城參觀了剛剛兵工廠和成立的軍校。
到了軍校之後，黃宗羲就十分驚訖，因爲這所軍校佔地極廣，足有數裡方圓，操場平整，一應設施齊全，而且學生的宿舍、教學的教室都是一色的紅磚瓦屋，不少房間的窗戶居然都是用的透明玻璃，顯得既整齊統一，又氣派美觀，可見商毅對這所軍校是下了不小的投資。
而且學生的年紀雖然都不大，但卻都是昂首闊步，精神煥發，就連走路的姿式也是虎虎生威，不過有不少學生們見了王夫之卻都十分尊敬，都立正站行禮，然後叫一聲：王先生或是王首長。雖然在黃宗羲看來，敬禮的姿式非常古怪，但卻顯得不僅是訓練有素，而且十分懂禮守紀。就是正規的軍隊，也做不到這一點。
隨後在王夫之的陪同下，黃宗羲還參觀了兩堂軍事課，黃宗羲對教授的軍事理論聽得似懂非懂，但看另一堂實戰技能訓練課卻看得十分認真，雖然都是十五六歲的少年，但一個個卻是生龍活虎，神情專注，態度極爲認真，完成動作也是一絲不苟，絲毫也絕不遜色於正規的軍隊。黃宗羲甚致覺得，就是自己在南京所見過的精銳明軍，也未必打得過這批娃娃兵。
王夫之一邊陪着黃宗羲看着，一邊也把軍校的組織結構，學校制度，教學內容等都像黃宗羲一一做了介紹。
看完了軍校之後，王夫之又帶着黃宗羲來到了兵工廠，廠長孫和鼎也早就收到了通知，親自出城迎接他們兩人，並且領着他們在廠區裡參觀，同時還付責向黃宗羲介紹兵工廠的情況。
原來以爲軍校就己經出乎於自己的想像了，見到了兵工廠的全貌之後，還是讓黃宗羲又大大的震驚了一次，兵工廠的規模不僅比學校更大，人數也更多，而且還有爲數不少的外國工匠在裡面做事。還有許多黃宗羲根本就叫不上名來的器械設備。同時生活設施幾乎是一應俱全，幾乎就是一座小城。
當然在這裡參觀可就不像在學校或是其他工廠裡那麼隨便了，有許多地方都有衛兵把守，進出都需要特定的證件，如果沒有證件，連王夫之也不能進入，孫和鼎雖然可以通行無阻，但也不能帶無證人員進入。另外雖然孫和鼎對黃宗羲的提問都回答得十分詳細，但涉及到兵工廠規模、產量、人數等問題，卻都告之不能回答。可見管理相當嚴格。
因此王夫之也只能向黃宗羲連連道賺。好在黃宗羲對此也不做強求，不讓進就不進了，不回答也就不打聽。當然看一看兵工廠的製成品到是不禁止，也是在兵工廠裡重點參觀的一項。在倉庫裡放置着百餘門各式各樣的火炮，一尊尊青光嶄亮，沉重而威嚴，還有數千杆火槍，排列的整整齊齊，還有其他霹靂火箭、手榴彈，甚至是刀槍盔甲，也使倉庫裡的氣氛不自覺的變得有些沉重起來。
參觀完兵工廠之後，己是下午吋分，黃宗羲和王夫之這才返回杭州。而在一路上，黃宗羲卻是沉默寡言，遠不如來時那麼談笑風生，顯得心事重重的樣子。如果說在杭州城裡參觀工廠、學校的時候，黃宗羲還是站在傍觀者的立場，而且多少還有一些讚賞這些做法的心態。但在參觀完了兵工廠和軍校之後，黃宗羲卻本能的意識到情況有些不對勁了。
軍校的作用十分明顯，就是陪養軍事人材，而兵工廠的規模製度之嚴、生產出來的武器數量之多，就是南京也大大不及，。如果軍校和兵工廠是甴朝廷來付責興建，那怕是委任商毅付責，到也是無可厚非，但現在卻是完全商毅的私人行爲，那可就大不一樣了。
而陪養的軍事人材、生產出的武器自然都是供商家軍使用，因此黃宗羲心裡也不能不冒出這樣一個念頭，軍校和兵工廠的規模和作用，己經遠遠超出了一個巡撫的行爲權力範圍，商毅這是打算幹什麼呢？