不過想想也對，雖然吳甡、黃宗羲等人有官職，但社會影響力不小，而且商毅對他們也還比較禮遇，如果是一般性質的產財糾紛，有他們出面，也就差不多了，就算他們敲不定，最多是去找王夫之或李巖出面，沒必要捅到自己這裡來。但政治問題，則又另當別論了。
既然是黃宗羲的朋友，一定不會一般人，不是東林就是復社，起碼和他們也有一定的關係，而且又是從廣西回來，估計就是和永曆朝廷有點關糸，甚致可能在永曆朝廷裡當過官，因此被人抓住這一點不放，進行誣告，到是很有可能。當然也不排除這個人真有值得懷疑的地方。到是要先調查清楚，不能妄下結論。
於是商毅道：“南雷先生，你這位朋友叫什麼名字，是怎樣和別人起的爭端。”
黃宗羲道：“他姓顧，名炎武，字寧人。”
商毅聽了，差一點從椅子上站起來，顧炎武，這不是明末清初三大宗師中的又一位嗎？自己曾經派人去他的老家崑山縣找過他，但自從南京失守之後，顧炎武就南下投靠了當時是隆武朝廷，一直就沒有再回到崑山，怎麼現在他又回來了，而且還在自己的治下吃了官司，不過顧炎武曾是復社的成員，屬於東林的傍系，而且和黃宗羲確實認識，兩人還有過一些學術交流，因此也笑道：“原來是亭林先生，我是久仰大名了。”
黃宗羲先是一怔，隨後又想起來，以前商毅曾引用過顧炎武所說的亡國與亡天下這一段話，他聽說過顧炎武，到並不是客氣話。而且聽這口氣，商毅對顧炎武的印像似乎還不錯，心裡又是一喜，這麼看來，顧炎武的這場官司，到是有着落了。因此也點了點頭，道：“就是他。”
商毅笑道：“如果是他，到是不用懷疑，我馬上下令到蘇州府，先將亭林先生釋放出來，不過俱體是怎麼回事，我總要弄清楚。”
黃宗羲趕忙道：“多謝王爺。不過這件事情還牽連到了崑山葉家。”
商毅聽了，也不僅苦笑了一聲，原來還扯到葉家去了。崑山葉家在蘇州也算是一個豪族，商毅接管了蘇州府的時候，葉家到是很快就倒向商毅，而在商毅稱了靖北王之後,曾經託人想和葉瑤瑱認親，這在中國古代是常有的事情，借用同姓的優勢，和皇宮裡的某位嬪妃認成親屬，雙方各取所需，內外互助，反正宗族的事情，誰都說不清楚。但被葉瑤瑱婉言謝絕了，不過在崑山一帶，卻仍有這種傳言，說葉家和葉瑤瑱是同宗。估計這件官司也有一點這個因素在裡面。
而這場官司的經過是這樣的，現在的家主名叫葉方恆，和顧炎武是同鄉，兩人還七拐八彎的有一點親戚關係，因爲葉、顧兩家都是崑山的豪族。
在崇楨末年，顧炎武的祖父顧紹芾及兄長顧緗去世，他的堂兄顧維、叔父顧葉墅和他發生了家產之爭，因爲顧炎武是過繼之子，因此叔父和堂兄都不想讓他繼承過多的家產，雙方鬧得不可開交，甚至顧炎武的家宅幾次被人洗劫及縱火焚燒，被迫搬了家。
雖然最後顧炎武分到一部分家產，但也虧了不少錢財，加之他交友甚廣，耗資頗多，經濟上也開始出現緊張，因此不得已把家裡的八百畝地抵押給了葉方恆，以換取一些週轉的錢財。
但葉方恆見顧炎武急於套現，因此拼命壓價，而由於迫於困境，顧炎武只得接受比實際價格低了一半的費用,將田地抵押給了葉方恆，當然葉方恆這樣做雖然有些不地道，但也無可厚非，從他的立場說，少花一分是一分，這時雙方也算是合法交易。但田產典押之後，葉方恆還遲遲不肯付款，後經顧炎武多次請求，兩年過後才討回一部分款項，明朝滅亡之後，而顧炎武爲復國奔走，又有幾年不在崑山，結果剩下的錢葉方恆一直都沒付。
等顧炎武回到崑山之後，因爲家庭生活拮居，當然又去向葉方恆討要剩下的錢，但這時顧家已元氣大傷，早己不在是豪族旺門，因此葉方恆就更加不想付款，而是準備賴掉剩下的欠帳。但顧炎武的性格本來就是十分剛烈，當初葉方恆拼命壓價，就讓顧炎武很不爽，現在居然還想懶帳，顧炎武自然不會答應，也威脅葉方恆要到蘇州府去狀告葉方恆。
雖然顧家巳經衰弱了，但當初白紙黑字，壓據收條都寫得清楚，葉方恆也知道這官司打到蘇州府去，自己八成要輸，而且現在是商毅當政，各地政府到不敢亂來，行賄恐怕也不好使，於是也來了一個先發制人，到蘇州去告稱顧炎武是永曆朝廷派到南京地區來的奸細。
正好顧家有一個家僕世奴叫陸通，隨着顧炎武把地抵押給了葉方恆之後，他也隨地一起，到了葉方恆家裡，成了葉家的家僕世奴，受葉方恆的指使，出面指證顧炎武。
這個罪名當然不小，蘇州府裡也不敢怠慢，立刻派人到顧炎武家裡搜查，而且這兩年顧炎武確實在廣西、廣東、福建一帶活動，並還做過幾天小官，回來的時候也帶了不少書信，結果蘇州府一查，把這些書信全都查了出來，而且顧炎武也確實是從廣西回來，又有家僕指證，這下人證、物證都齊了，於是馬上將顧炎武抓了起來。
顧炎武被抓之後，家人親友也都急忙想辦法營救，其實現在的司法部門真得還很守規據，到不敢胡來，但顧炎武的案子是私通南明，十分敏感，因此到也很難周旋。
就這樣顧家的親友走託人情，找到了黃宗羲那裡。現在的黃宗羲和顧炎武並沒有什麼深交，不過互相認識，也很佩服對方的學問，但他也知道顧炎武的案子可大可小，但涉及政治層面，並不好走通，王夫之、李巖都不好出面，除非是商毅一句話。但他自知自已和商毅乜沒有什麼交情，於是只好拉上和商毅關係最好的吳甡，一起來請見商毅。爲顧炎武說項。而這時顧炎武入獄己有一個多月了。
聽黃宗羲說完了整個事情的前因後果之後，商毅也基本弄明白是怎麼一回事。嚴格來說，蘇州府的做法並不算錯，畢竟顧炎武也確實有值得懷疑的地方，而且在這種非常時期，也不得不將懷疑面擴大一些。爭奪天下不是請客吃飯，大家和和氣氣，而是地地道道的暴力手段，說得難聽一點，不是你死就是我活。而且自己己經算是非常剋制了，而且還一直告誡安全部，不能毫無理甴的胡亂抓人、動刑，如果是在明朝的錦衣衛，估計現在監獄都不夠用了。畢竟和南明朝廷有些聯繫的人確實太多了。
顧炎武的案子當然是可以當做特案來辦，但不能把顧炎武案當一個標準，因而在以後就放鬆了警惕，因此商毅首先向黃宗羲保證，自己一定會詳查顧炎武案，同時又把成立參政院的計劃告訴吳甡和黃宗羲，並請他們轉告給史可法等人，希望他們能夠考慮接受邀請。
其實顧炎武的案子並不複雜，就看性質怎麼定了，因爲現在所有的證據都只能說明顧炎武和南明之間曾經有關係，但不能說顧炎武和南明有勾結或是南明派來的奸細。畢竟現在和南明之間有一些關係的人，確實太多了，不可能全都抓起來。
在商毅給顧炎武案定性之後，其他的事情也就都可以迎刃而解了，因此整個案子的前因後雖也很快就都查清楚了，顧炎武並不是南明派來的奸細，而是由於葉方恆爲了賴掉顧家抵押田產的剩餘費用，支使家僕陸通誣告顧炎武。
在半個月之後結案，顧炎武也被得以無罪釋放，但從廣西回來，並未及時通知蘇州政府備案，也有其不對之處，但己經入犾一個半月，也就不予追究；陸通以奴誣舊主，被判以入獄十年，發配流球去充做苦役；而葉方恆爲了賴帳，支使家奴誣告好人，被罰入獄監押三個月，除將顧家的欠款立刻還清之外，另罰白銀三千兩。
從結果來看，陸通最冤，因爲他是受葉方恆的指使幹事，也是身不由己，但按大明例律，他的罪確實最重，因爲他是家僕世奴的身份。家僕世奴和佃戶差不多，也就是爲了逃避稅役，而投充到大縉紳地主家下掛名爲奴僕，但本身還是自由農民，也可能會有自己的田地，不過需要對主家承擔一定的義務。而且這個身份也可以在縉紳地主進行轉讓。
現在商毅還沒有制定自己的法律，因此只能依大明例律判決，而結果也就是這樣，要覺得冤也沒辦法。
同時商毅又下令各地，毎是曾在南眀政府任職、或有來往聯絡書信等物，限期三個月，到當地政府上交備案，可以既往不咎，但如有隱藏不報，或拒不上交者，一經察出，必將嚴懲。