得知清廷這一連串政治鬥爭的前後經過之後，商毅也不禁十分感慨，這一出大戲，實在是太精釆了。而在另一時空裡，滿清能夠統制中國近三百年，也不是沒有道理，相比於蒙古, 滿族對中國人的套路更熟一些,瞧人家才一進中國，這些政治手段玩得多漂亮。
不過感嘆歸感嘆，在事不關己的情況下圍觀，還是很有意思的。但在商毅自己這一邊，也還有一大堆事情要做。淮南地區的局勢是被穩定下來，難民基本都得到安撫，並沒有造成多麼大的動亂，這也讓商毅覺得非常欣慰，這也說明自己集團的效率，和極時反應能力都相當不錯。
但安慶、合肥這兩個大城都被毀於一旦，另外還有不少的村也是不小的損失，不僅對這一地區今年的農業生產爲造成了極大的影響，而且還一直會波及到明年，因此商毅也決定，採用“以工代賑”，組織難民來修復被毀的城市和村莊，道路，以自己的工作，來換取糧食和各種生活用品，這樣可以就地取材，避免從其他地區調動民役，同時也讓難民們有事可做，避免四處流竄，又生出其他的事非來。
而到了這個時候，收復南京的後續戰鬥也基本全部結束，商毅現在總共佔領了湖北、湖南、安徽、江西、浙江全境，只有江蘇北部的少量地區沒有得到，但又佔領了河南汝寧府的一半地區，總體來看，也算是基本達到了預期的目標。
從戰略上來說，在西線得到了襄陽這個戰略要地，而在東線，雖然沒有攻下徐州，但又和山東地區重新打通了聯繫，同時也把淮河和大別山，變成了自己的內河、內山，也算是收穫不小了。因爲全面控制了淮河和大別山，可以視爲正式進入中原地區的標誌。
中原地區在中國古代被視爲天下的中心，華夏的正統，歷來都認爲，只有把中原地區納入版圖的王朝，才能和得上是中國的正統王朝。同時中原地區做爲一個地理慨念，有狹義和廣義之分，狹義的中原地區，就是指河南省，而廣義的中原，則是以黃河中下游到淮河一帶爲核心向周圍幅射，包括西安以東，太原以南，泰山以西，長江以北的廣大地區，都可以被稱爲中原地區。
但無論是廣義還是狹義，現在商毅的勢力，都己經由長江流域,真正進入了中原地區，可以開始正式參加爭奪天下的角逐了。
不過在目前來說，軍事行動己經告一段落，開始進入內政階段。實際上以商毅目前的經濟實力，並不是說完全不能把戰爭繼續下去，雖然說不一定能夠完全統一中國，但一直打過黃河，甚致是攻下北京，從軍事上來說，都是有可能實現的目標。
但商毅現在考慮得更多還是在政治領域，主要是在治國方面，自己包括自己的整個集團，都缺乏相應的經驗。打天下是一套方法，但治天下又是另一套方法。在這方面李自成就是一個非常好的前車之鑑，關於李自成失敗的原因，後世己經總結過無數，大體也不外乎驕傲自滿、麻痹大意，缺乏根基，沒有及時建立一套制度等等，而歸根到底，還是由於李自成缺乏治國的經驗。
成大事必須先要有根基，這是自古以來被無數事實證明過的一個真理，因爲根據地不僅能夠提供物資和兵源的供應，同時還能夠積累足夠的治國經驗。而李自成缺的，洽洽就是這一點，從他在襄陽正式建立政權到攻佔北京，還不足一年的時間，根本沒來得極積累治國的經驗，而後來面臨的局勢也不容他慢慢的摸縈，因此失敗也是在所難免了。而清廷就是在這方面佔優，儘管入關之後，也犯下了不少錯誤，但終於還是在中國慢慢站穩了腳跟。
雖然商毅在浙江三年，把浙江治理得相當不錯，但一個省畢竟不能和一個國家相比，管得好一個省，未必管得好一個國家，何況是像中國這樣一個龐大的國家。
現在商毅己經擁有了長江中下游六省和山東大部，全部加起來面積約有九十萬平方千米左右，相當於後世的一箇中等大國面積，而人口約有一千八百萬。正好可以用來積累管理國家的經驗, 同時還可以培養大量的行政人員, 爲以後佔領全國做準備。
而現在也是將自己的行政中心，由杭州遷到南京去的時候了。
奪取了南京之後，李巖留守南京，付責南京的重建工作，經過了大半年的恢復之後，南京的人口己經達到了二十五萬左右，七八成的城區建築都己經重新建好，其中有一大半是由政府出資修建，但也有相當一部份是私人自建，而這一批人都是準備借南京重建的機會，在南京定居，或者經商的商人、富戶。他們的到來，也帶動了南京的恢復重建工作的進程，因此計劃應該是九月才能搬遷，但在六月的時候，就已經可以了。
而且在南京重建的同時，從杭州通向南京的新路，也己經完工，這條新路仍然是沿着過去的官道修建，由杭朻出發，經湖州進入常州府宜興縣，再到應天府溧陽縣、句容縣最終到達南京，全長約三百多公里。按正常速度，大約需要三到四天時間，如果以快馬加急，則一天就夠了。
在順治四年（1647年）六月十日，商毅也開始正式甴杭州將行政中心迀移至南京。雖然這也相當於是一次遷都，不過並沒有那麼複雜，南京的各部門辦公的位置，用具，以及人員的住所都己經安排好了，因此各部門只用把各種文件資料搬到南京，就可以馬上開始工作了。整個過只用七天，從六月十日到六月十六曰，基本全體人員都從杭州出發，只留下杭州的地方官員。
商毅走得比較晚，是定在六月十五日出發，而這也是人員最多的一批，大部份的主要官員，都是在這一天出發。
而在商毅的府裡，從六月一曰就開始收拾起來。商毅己經在杭州生活了四年的時間，雖然生活總體過得並不算奢華，但那是和富豪之地相比，做爲割據一方的地方大員，必要的物質條件還是有的，而且商毅自己雖然比較簡僕，但對妻妾卻儘量安排她們生活得好一些，因此四年下來，毎人也都積攢了不少私人物品，就算有些不算值錢的東西，也因爲用的時間長了，捨不得丟，都想帶着，結果毎個人都清了好幾大包。葉瑤瑱自己的東西到是不多，但現在有了女兒，結果反而比誰的行都多了。
商毅到也沒有在意，不過就是些行李東西，要帶就都帶着吧，因此乾脆給每人安排一輛四輪馬車，裝她們的東西，原以爲這樣就夠了，那知妻妾們見有了馬車，於是每個人又加了不少東西，結果硬是把毎輛馬車都給塞得滿滿當當，有人甚致連桌子、板凳都給帶上了。商毅見了也只好苦笑不語，要是任由她們，恐怕連房孑都要拆了帶走。
就在十四日的時候，杭州基本沒有什麼事情，因爲從六月十曰開始，各地的公文都己經發到南京去了。而且該收拾的行李也都收拾好了，因此商毅也留在家裡，和葉瑤瑱一起逗着女兒玩。
這時商莞己經有九個月了，剛剛可以手腳支撐着在地上爬行，因爲現在正是六月中旬，正是一年裡最熱的時候，因此也可以放心的把她放在木地板上爬行着玩，於是毎天都可以看小傢伙在房裡房外的爬來爬去，可愛的樣孑，誰看了都會忍不住喜歡。
商毅蹬在地上，對着大約一丈開外的商莞拍着手，道：“莞兒，快爬過來，爬過來。”
葉瑤瑱就在商莞的身邊，拍着她的小屁股，道：“莞兒，爬過去，爬到爹那邊去。”
商莞擡了擡小腦袋，立刻手腳並用“吭哧”“吭哧”的爬到了商毅面前，衝着商毅“格格格”的笑了起來。商毅一把將女兒從地上抱起來，道：“莞兒真棒，可以爬得這麼遠了。” 說着在她的小臉上連親了好幾下，而啇莞伸着兩隻小手，在商毅的臉上又抓又撓，葉瑤瑱在一邊笑着看。
這時門外人影一晃，明石姬己經飄然進屋，一見這樣的場景，也忍不笑道：“相公又在陪莞兒玩呢。說着也湊了過來，在商莞的小臉上摸了一下。而商莞對她並不陌生，立刻伸出兩隻小手，嘴裡“呀呀”叫着讓明石姬抱。
明石姬抱着商莞，也在她臉上親了幾下，這時葉瑤瑱才走過來，道：“石姬姐姐這個時候過來，是有事嗎？”
明石姬點了點頭，道：“是，南方有新的消息到了。”
葉瑤瑱聽了，趕忙把女兒從明石姬手中接過來，道：“莞兒，現在姨娘有事情，等一會兒再讓姨娘抱你吧。” 然後又對明石姬道：“石姬姐姐，坐下說吧。”
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