其實城門被砸開，也並不就等於城池以經失守，因爲城門口十分狹小，進攻兵力無法全面展開，如果守軍全力防守，也不是沒有守住的可能，至少也能夠頂一陣子，而且這時商家軍還沒有派出士兵，去搶佔被自己砸開的城門洞。
但對左軍來說，心理上的防線卻以經徹底崩潰了。經過前兩次敗仗之後，左軍現在對商家軍以經懷有很深的恐懼感，因爲是有城牆可守，士兵們還能免強頂着，而城門被商家軍的火炮轟開之後，在絕大士兵的心裡，這一仗就以經敗了，咸寧是肯定守不住了。因此士兵們立刻就慌亂了起來，紛紛扔掉武器，跑下了城牆，向其他的城門方向逃竄。
左良玉也沒有想到，自己手下的士兵竟然對商家軍害怕成這個樣，又氣又急，他拔出佩刀，在空中揮舞了幾下，大聲道：“不要害怕，不要害怕，商家軍還沒有進城，守住城門，快去守住城們，我們是一定可以擋住商家軍的。”
但左良玉喊了半天，卻沒有人理他，士兵們還是照樣亂跑，有人一邊跑着還一邊大喊：“商家軍殺進來了，咸寧守不住了，大家快跑啊。” 這句話可比左良玉喊得有用得多，一下子就在士兵中傳揚開來。
只氣得左良玉頓足捶胸，回頭一看，卻發現自己身邊的士兵也只剩下了一半，七門火炮到有五門火炮的炮兵都逃跑了。看得左良玉也目瞪囗呆，但也一點辦法也沒有。而這時***也道：“大帥，我們也撤吧，現在弟兄們都差不多跑光了，等商家軍殺進城來，我們說不定就都跑不了了。”
左良玉一聽，也是道理，也正要下令撤的時候，忽然金聲桓大叫道：“大帥你看，商家軍撤軍了。”
左良玉呆了一呆，懷疑自己是不是聽錯了，但忽然也想起來，好像商家軍有一陣沒有開炮了，因此左良玉趕忙趴着城垛口，向城下看去，果然見商家軍正在收拾陣地上的火炮，牽過馬來套車，而且後隊以經向後轉，變成了前隊，依次的撤退。
看到商家軍突然撤軍，左軍的諸將都忍不住齊聲歡呼起夾，而左良玉也長出了一口氣，這可真是要謝天謝地謝人了，商家軍居然是撤軍了。然後趕忙命人去收隴城中的亂兵，同時又把城門趕緊修好關閉，嚴密守衛。不過左良玉的心裡卻又犯了嘀咕，商毅這葫蘆裡到底是賣的什麼藥，是真打算留給自巳一條活路，還是想玩一把貓戲老鼠的把戲。
其實商毅雖然不是一個瞠目必報的人，但也決不會得饒人處且饒人。商毅的原則是不要輕易的去惹別人，但如果惹了別人，那就要讓別人不敢再來惹自已。因此依他的性子，肯定是要殺入咸寧去，把左良玉給趕出城去，徹底把左良玉打得伏伏帖帖爲止。而之所以會在眼看大勝的時候撤軍，完全是因爲吳甡到了。
原來得知商毅以經收復了武昌府之後，吳甡也不禁大喜過望，因爲武昌府可是湖廣的治所之地，收復武昌府，可以說是出京督師以來最大的一個勝利。而且如果能夠一鼓作氣，消滅掉張獻忠，那麼自己不敢說是功高蓋世，至少也是本朝的第一功了。因此在這一刻，吳甡的心裡也充滿了建功立業，成爲本朝第一功臣的雄心壯志。
於是吳甡也決定，要親自到陣前去督戰。雖然在出戰之前，吳甡答應過商毅，不會干涉他作戰，但現在參與圍剿張獻忠的，可不是商毅這一支人馬，需要有一個人去坐鎮協調指揮，而這個人自然是非吳甡不可了，相信商毅也是能夠理解這一點。
於是吳甡立刻帶領着馬科和一萬人馬，也渡過長江，趕到湖廣境內，來到了武昌，才知道商毅以經把張獻忠逼到了咸寧，於是吳甡馬上又趕來到了咸寧，正好遇見了劉良佐和黃得功的大營，因此先來到這兩人的大營詢問目前的情況。
那次這一問才知道，原來明軍不僅讓張獻忠給跑了，而且商毅和左良玉還打了起來。這一下可把吳甡也嚇得不清，說實話，現在這兩個人無論是那一個，吳甡都得罪不起，無論是逼反了那一個，自己身爲督師，都是脫不了干涉的，而在朝中的陳演，也絕不會錯過這個整倒自己耐機會。因此吳甡趕忙於是帶着劉良佐和黃得功前來調停，正好這時商毅正在進攻咸寧，吳甡來到商毅的軍中，極力相勸商毅，請他不要魯莽行事，還是先撤軍，其他的事情慢慢再談。
而商毅想了一想，也覺得現在還是不要和吳甡把關係弄疆了，因此也決定給吳甡一個面子，雖然以經轟開了咸寧，但還是下令撤軍。反正要攻下咸寧，隨時都可以。
衆人一起回到了商毅的大營，吳甡這才問起這是怎麼一會事，商毅也把整個事情的經過都說了一遍，同時又把左夢庚還有左軍的一些俘虜都帶了上來，讓吳甡過目，並且由吳甡問話。
其實也不用怎麼問，吳甡基本都相信了商毅的話，這主要還是因爲左良玉的名聲太差，吳甡督師都快三個月了，在名議上是左良玉的上級，但向左良玉連下了六道檄令，而左良玉居然連個面都不給見，現在是不把自己放在眼裡。而商毅雖然也些不服管教，但也比左良玉強得多，而且打仗還是十分買力，這次南下完全就是他一個人在撐着大局，因此吳甡心裡自然會偏向商毅了。
而且得知商毅把左良玉打得大敗，連左良玉的兒子都給抓了起來，吳甡表面上雖然不說，但心裡卻是十分高興，早就該教訓教訓左良玉了，他簡直就狂得沒邊了。吳甡甚致還想，要不要趁這個機會，乾脆就把左良玉給解決掉算了。他知道現在崇禎和朝廷早就對左良玉非常不滿了，只不過現在內憂外患，又顧忌左良玉人馬衆多，因此纔沒有動他。但現在有了商毅，完全能夠製得住左良玉了，如果自己能夠幫助朝廷順便解決這個麻煩，那可又是一件大功。
不過這個念頭只在吳甡的頭腦裡一閃而去，就立刻被吳甡否定掉了，因爲左良玉畢竟還是實力雄厚，萬一事情做得不周密，沒能解決得左良玉，反到把他給逼反了，可就麻煩大了。商毅手裡有兵有，到是沒什麼，而自己是一定要承擔這個責任，之前督師所建立的這些功勞可就全都傅諸流水了，那麼自己可就是畫虎不成反類犬了。因此還是不要節外生枝爲好。
而在另一方面，吳甡也考慮剄，想要解決左良玉，只能依靠商毅，而就算能順利的把左良玉給解決掉，但商毅完全有能力成爲下一個左良玉，到時候又有誰能去制住商毅呢？
因此在吳甡心裡，也很快給這件事情定下了一個調子，那就是盡力和平解決，施恩於左良玉，讓左良玉和商毅互相牽制。這纔是最好的辦法。
於是吳甡又勸商毅，還是應當以大局爲重，畢竟左良玉也是朝廷官員，如果鬧到了朝廷中去，對商毅日後的仕途也有影響。萬一真把左良玉給逼反了，那就更不好收拾了。
其實商毅並沒有要把左良玉趕盡殺絕的意思，只是要教訓教訓他而己，既然吳甡這麼說了，也正如借梯下牆，滿口答應下來。但啇毅堅持一定要左良玉親口認錯，並且賠償錢糧物資，這是贖回左夢庚的費用。當然這些錢糧物資黃得功和劉良佐也有一份，這可是商毅當初答應他們的。
對商毅的這個要求，吳甡到也沒有什麼意見，因爲在他心裡也覺得有必要好好教訓一下左良玉，也讓左良玉別在那麼驕狂下去，日後也好使喚他幹活。反正是讓商毅來當這個惡人，自己裝和事佬。而黃得功和劉良佐更沒意見，反正是由商毅出面去敲左良玉的竹槓，自己乾落得現成的，有這樣的好事，那又何樂而不爲呢？
於是衆人商議決定，在當天下午，吳甡帶着黃得功和劉良佐進了咸寧，來見左良玉，對他曉以利害，時而聲色俱厲，時而好言安撫，總之是軟磨硬泡，逼着左良玉服軟不可。
而上午的攻城戰也使左良玉徹底明白，商毅可不是朝廷，能夠由自己盤弄，而且自己現在根本就沒有和商毅討價還價的資格，吳甡肯出面來調停，以經是給了自己一個臺階，如果自己還不下，那也就只有立刻造反了。反正君子報仇，十年不晚，今天先忍下這一口氣，以後再慢慢想辦法找商毅算這筆帳。
於是雙方又經過了一輪討價還價，最終決定，左良玉向商毅賠償白銀十萬兩，糧食三萬石——這些都是張獻忠送給左良玉的，結果在左良玉手裡還沒捂熱乎，就馬上讓出來了。不過吳甡也爲顧全左良玉的面孑，不要他當面向商毅賠禮道歉，寫封信算了。
好在商毅也不在乎這個，只要左良玉服軟了就行，他當然不指望左良玉以後就老實了，但至少左良玉想找自己的麻煩，也要仔細的想一想，能不能承但得起自己報復的後果。因此左良玉把錢糧送到商毅的大營之後，商毅也把左夢庚給放了。
隨後商毅又分給劉良佐和黃得功兩人各兩萬兩白銀，五千石糧食。這件事情也終於得到了圓滿的解決。